Анализы ДНК в Украине
Все анализы/Панели (секвенирование NGS)
В панель Аутовоспалительные заболевания входит 47 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на аутовоспалительное заболевание. Гены этой панели входят в панель Первичные иммунодефициты.
Аутовоспалительные синдромы представляют собой группу заболеваний, характеризующихся повторяющимися эпизодами воспаления без признаков воздействия ауто-антигена. Эпизоды могут возникать периодически или нерегулярно. Наследственные периодические лихорадки являются типичным примером заболеваний этой группы. Помимо лихорадки и локализованного воспаления, эти заболевания могут вызывать и другие симптомы, специфичные для синдрома. Семейная средиземноморская лихорадка (FMF) — наиболее распространенный из синдромов периодической лихорадки, распространенность которого в различных популяциях составляет от 1:250 до 1:1000. Это наиболее распространенный вид в восточном Средиземноморье. Другие синдромы встречаются гораздо реже. Пенетрантность синдромов периодической лихорадки варьирует: при одних конкретных заболеваниях она высока, при других может быть снижена. Кроме того, модели наследования различаются: обычно они являются аутосомно-рецессивными, например, для семейной средиземноморской лихорадки и мевалоновой ацидурии, тогда как они являются аутосомно-доминантными для периодического синдрома, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, и для семейного холодового аутовоспалительного синдрома.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACP5 | Спондилоэнхондродисплазия с иммунной дисрегуляцией | AR | 12 | 26 |
ADAM17 | Воспалительные заболевания кожи и кишечника у новорожденных 1 | AR | 1 | 7 |
ADAR | Наследственный симметричный дисхроматоз, синдром Айкарди-Гутьера | AD/AR | 25 | 226 |
CARD14 | Псориаз | AD | 9 | 29 |
CECR1 | Узелковый полиартериит, дефицит ADA2 | AR | 15 | 50 |
COPA | Аутоиммунные интерстициальные заболевания легких, суставов и почек | AD | 6 | 6 |
DDX58 | Синдром Синглтона-Мертена | AD | 4 | 3 |
DNASE1L3 | Системная красная волчанка 16 | AR | 1 | 3 |
DNASE2 | Синдром аутовоспалительной панцитопении | AR | 2 | |
ELANE | Нейтропения | AD | 43 | 217 |
IFIH1 | Синдром Синглтона-Мертена, синдром Айкарди-Гутьера 7 | AD/AR | 14 | 19 |
IL10 | Воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона) | AD/AR | 1 | 5 |
IL10RA | Воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона) | AR | 4 | 43 |
IL10RB | Воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона) | AR | 2 | 19 |
IL1RN | Остеомиелит стерильный многоочаговый с периоститом и пустулезом | AR | 6 | 12 |
IL36RN | Пустулезный псориаз, генерализованный | AR | 6 | 26 |
ISG15 | Иммунодефицит с кальцификацией базальных ганглиев. | AR | 3 | 3 |
JAK1 | Первичный иммунодефицит | AD/AR | 4 | 6 |
LPIN2 | Синдром Маджида | AR | 12 | 14 |
MEFV | Семейная средиземноморская лихорадка | AD/AR | 29 | 182 |
MVK | Мевалоновая ацидурия, синдром гипер-IgD, порокератоз 3, множественные типы | AD/AR | 35 | 181 |
NLRC4 | Аутовоспаление с детским энтероколитом (AIFEC), Семейный холодовой аутовоспалительный синдром 4 | AD | 6 | 8 |
NLRP1 | Ладонно-подошвенная карцинома, множественное самоизлечение, аутовоспаление с артритом и дискератозом | AD/AR | 5 | 15 |
NLRP12 | Семейный холодовой аутовоспалительный синдром | AD | 12 | 12 |
NLRP3 | Мультисистемное воспалительное заболевание с неонатальным началом (NOMID), синдром Макла-Уэллса, хронический детский неврологический кожно-суставной синдром (CINCA), семейный холодовой аутовоспалительный синдром 1, глухота | AD | 20 | 136 |
NOD2 | Синдром Блау, саркоидоз, раннее начало, болезнь Крона | AD | 12 | 70 |
OTULIN | Синдром аутовоспаления, панникулита и дерматоза (АИПДС) | AR | 8 | 3 |
PLCG2 | Семейный холодовой аутовоспалительный синдром 3 (PLAID), аутовоспаление, дефицит антител и синдром иммунной дисрегуляции (APLAID) | AD | 7 | 13 |
POMP | Линейный кератоз с врожденным ихтиозом и склерозирующей кератодермией | AR | 5 | 4 |
PRG4 | Синдром камптодактилии-артропатии-тазика вара-перикардита | AR | 6 | 35 |
PSENEN | Обратные угри, семейные, 2 | AD | 7 | 17 |
PSMB4 | 4 | 4 | ||
PSMB8 | Синдром Накайо-Нишимуры, Хронический атипичный нейтрофильный дерматоз с липодистрофией и синдромом повышенной температуры, Синдром аутовоспаления, липодистрофии и дерматоза, Контрактуры суставов, мышечная атрофия, микроцитарная анемия и синдром липодистрофии, вызванной панникулитом | AR | 5 | 9 |
PSTPIP1 | Гнойный стерильный артрит, гангренозная пиодермия и угри. | AD | 5 | 29 |
RIPK1 | Синдром аутовоспалительной панцитопении | AD/AR | 3 | 1 |
RNASEH2A | Синдром Айкарди-Гутьера | AR | 13 | 21 |
RNASEH2B | Синдром Айкарди-Гутьера | AR | 16 | 41 |
RNASEH2C | Синдром Айкарди-Гутьера | AR | 6 | 14 |
SAMHD1 | Синдром Айкарди-Гутьера, обмороженная волчанка 2 степени. | AD/AR | 25 | 56 |
SLC29A3 | Гистиоцитоз-лимфаденопатия плюс синдром, Дизостеосклероз | AR | 17 | 25 |
TMEM173 | Васкулопатия, связанная с STING, с инфантильным началом (SAVI) | AD/AR | 4 | 10 |
TNFAIP3 | Аутовоспалительный синдром, семейный, Бехчетоподобный | AD | 8 | 23 |
TNFRSF1A | Периодическая лихорадка (периодический синдром, связанный с рецептором TNF) | AD | 19 | 106 |
TREX1 | Васкулопатия сетчатки с церебральной лейкодистрофией, обмороженной волчанкой, синдромом Айкарди-Гутьера | AD/AR | 30 | 71 |
TRNT1 | Пигментный ретинит и эритроцитарный микроцитоз, сидеробластная анемия с В-клеточным иммунодефицитом, периодические лихорадки и задержка развития. | AR | 13 | 26 |
TTC7A | Желудочно-кишечные дефекты и синдром иммунодефицита | AR | 21 | 46 |
UBA1 | Спинальная мышечная атрофия, детская | XL | 3 | 5 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.