Панель Наследственный колоректальный рак

В панель Наследственный колоректальный рак входит 23 гена, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.

Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на наследственную предрасположенность к колоректальному раку. Эта панель предназначена для выявления наследственных мутаций и не должна использоваться для выявления соматических мутаций в опухолевой ткани. Гены на этой панели включены в панель наследственного рака желудочно-кишечного тракта и в комплексную панель наследственного рака. Колоректальный рак — одно из самых распространенных онкологических заболеваний во всем мире с выраженным наследственным компонентом. Наследственные синдромы колоректального рака можно разделить на неполипозные синдромы и полипозные синдромы. Наиболее распространенной формой наследственного колоректального рака является синдром Линча (также известный как наследственный неполипозный колоректальный рак). По оценкам, на его долю приходится 5% всех случаев. Синдром Линча является аутосомно-доминантным синдромом, вызванным мутациями в генах репарации несоответствия, в основном MLH1, MSH2, PMS2 и MSH6. Пациенты с MLH1 или MSH2 имеют примерно 50-80% пожизненный риск развития колоректального рака, а женщины имеют примерно 40% риск рака эндометрия.

Семейный аденоматозный полипоз характеризуется развитием от сотен до тысяч аденоматозных полипов по всей толстой кишке. При отсутствии лечения пациенты имеют почти 100% вероятность развития колоректального рака к возрасту 35-40 лет. Он вызывается мутациями в гене APC, поражает примерно 1 из 10 000 человек и составляет 0,5–1% всех случаев колоректального рака. У пациентов с семейным аденоматозным полипозом могут проявляться внекишечные признаки, такие как папиллярная карцинома щитовидной железы и гепатобластомы.

Другие более редкие синдромы включают: MUTYH-ассоциированный полипоз, фенотип напоминает таковой при семейном аденоматозом полипозе, но у пациентов, как правило, развивается меньше полипов (5-100) и диагноз ставится в более старшем возрасте. MAP вызывается биаллельными мутациями зародышевой линии в гене MUTYH.

Синдром Пейтца-Егерса, PJS характеризуется гамартомными полипами кишечника и пигментацией кожи и слизистых оболочек. Полипы чаще всего локализуются в тонкой кишке, но могут также возникать в любом месте желудочно-кишечного тракта. У пациентов повышен риск развития внекишечного рака. Синдром Пейтца-Егерса вызывается мутациями зародышевой линии в гене STK11. Распространенность PJS составляет примерно 1 на 200 000.

Ювенильный полипоз : характерными чертами являются множественные гамартомные полипы в толстой и прямой кишке и повышенный риск рака толстой кишки, желудка, тонкой кишки и поджелудочной железы. Генами, вызывающими ювенильный полипоз, являются SMAD4 и BMPR1A. Распространенность оценивается как 1: 100 000.

индром Каудена характеризуется множественными гамартомными опухолями, которые чаще всего появляются на коже, кишечнике, груди и щитовидной железе. Пациенты имеют особенно высокий риск рака молочной железы и щитовидной железы. Мутации в PTEN были описаны у 80% пациентов с синдромом Каудена. Совсем недавно мутации в POLE, POLD1 и GREM1 были связаны с наследственной предрасположенностью к колоректальному раку.

Гены, входящие в панель:

* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);

** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.

Возможная персонализация панели

В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .

Преимущества этого теста

• Лаборатория (США), аккредитованная САР
• Персонал, сертифицированный CLIA, проводит клинические испытания в лаборатории, сертифицированной CLIA.
• Мощные технологии секвенирования, передовые методы обогащения мишеней и конвейеры точной биоинформатики обеспечивают превосходную аналитическую производительность.
• Тщательное составление клинически эффективных и научно обоснованных генных панелей
• Общедоступная аналитическая проверка, демонстрирующая полную информацию о производительности теста
• Анализ некодирующих вариантов, вызывающих заболевания
• Анализ делеций и дупликаций
• Строгая схема классификации вариантов
• Систематический рабочий процесс клинической интерпретации с использованием проприетарного программного обеспечения, обеспечивающего точную и прослеживаемую обработку данных NGS.
• Подробнейшее клиническое заключение на английском и украинском языках
• Бесплатно сырые данные в формате .vcf

Что дальше?

Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.

Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.

Как пройти исследование

Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.

Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.

Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.

Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.