Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель буллезный эпидермолиз - панель из 26 генов, которая включает оценку некодирующих вариантов. Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на врожденный буллезный эпидермолиз.
Буллезный эпидермолиз представляет собой группу наследственных заболеваний, характеризующихся образованием пузырей на коже и слизистых оболочках, чаще всего возникающих в местах трения и незначительных травм, таких как стопы и руки. При некоторых подтипах волдыри могут также появляться на внутренних органах, таких как пищевод, желудок и дыхательные пути.
Существует 4 основных типа буллезного эпидермолиза, основанных на различных участках образования пузырей в структуре кожи:
Простой буллезный эпидермолиз, СЭБ обычно характеризуется ломкостью кожи и редко эпителия слизистых оболочек, что приводит к образованию нерубцовых волдырей, вызванных легкой травмой или ее отсутствием. Четыре наиболее распространенных подтипа СЭВ: 1) локализованный (также известен как тип Вебера-Коккейна), 2)типа Даулинга-Мира , 3) генерализованный, также известный как тип Кебнера) и 4) с пятнистой пигментацией. Биопсия кожи из свежего волдыря считается обязательной для диагностики генерализованных форм простого буллезного эпидермолиза. Распространенность простого буллезного эпидермолиза оценивается в 1:30 000 - 50 000. Пенетрантность составляет 100% для известных мутаций KRT5 и KRT14. Было показано, что расположение мутаций в функциональных доменах KRT5 и KRT14 предсказывает фенотип простого буллезного эпидермолиза.
Соединительный буллезный эпидермолиз, характеризуется ломкостью кожи и слизистых оболочек, что проявляется образованием пузырей при незначительной травме или без нее. Образование пузырей может быть тяжелым, а грануляционная ткань может образовываться на коже вокруг ротовой и носовой полостей, пальцев рук и ног, а также внутри вокруг верхних дыхательных путей. Вызывается мутациями в LAMB3 (70% всех случаев), COL17A1 (12%), LAMC2 (9%) и LAMA3 (9%).
Дистрофический буллезный эпидермолиз вызывается мутациями COL7A1 и может быть доминантным или рецессивным. Доминатный обычно проявляется в легкой форме. Волдыри могут быть локализованы на руках, ногах, локтях и коленях или могут быть генерализованными. Рецессивный обычно более генерализованный и тяжелый, чем доминантный.
Синдром Киндлера встречается очень редко и поражает все слои кожи, характеризуется крайней хрупкостью.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ATP2C1 | Доброкачественная хроническая пузырчатка | AD | 17 | 185 |
CDSN | Синдром шелушения кожи, гипотрихоз | AD/AR | 6 | 14 |
COL17A1 | Эпителиальная рецидивирующая эрозионная дистрофия (ERED), буллезный эпидермолиз, узловой, не-Herlitz | AD/AR | 32 | 112 |
COL7A1 | Поражение ногтей, несиндромальное врожденное, Транзиторный буллезный дермолиз новорожденных, Дистрофический буллезный эпидермолиз, Претибиальный буллезный эпидермолиз, Почесуточный буллезный эпидермолиз | AD/AR | 159 | 816 |
CSTA | Синдром шелушения кожи 4 | AR | 5 | 6 |
DSG1 | Тяжелый дерматит, множественные аллергии и синдром метаболического истощения (синдром SAM), полосатый ладонно-подошвенный кератоз I | AD/AR | 13 | 31 |
DSG2 | Аритмогенная дисплазия правого желудочка, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 44 | 129 |
DSG4 | гипотрихоз | AR | 8 | 18 |
DSP | Кардиомиопатия, дилатационная, с шерстяными волосами, кератодермией и агенезией зубов, Аритмогенная дисплазия правого желудочка, семейная, Кардиомиопатия, дилатационная, с шерстяными волосами и кератодермией, Ладонно-подошвенный полосатый кератоз II, Буллезный эпидермолиз, летальный акантолитический | AD/AR | 177 | 296 |
DST | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная | AR | 13 | 7 |
EXPH5 | Буллезный эпидермолиз | AR | 2 | 10 |
FERMT1 | Синдром Киндлера | AR | 32 | 83 |
GRIP1 | Синдром Фрейзера | AR | 5 | 17 |
ITGA3 | Интерстициальное заболевание легких с нефротическим синдромом и буллезным эпидермолизом | AR | 6 | 11 |
ITGA6 | Буллезный эпидермолиз, узловой, со стенозом привратника | AR | 2 | 8 |
ITGB4 | Простой буллезный эпидермолиз, Weber-Cockayne, буллезный эпидермолиз, узловой, с атрезией привратника, буллезный эпидермолиз, соединительный, не-Herlitz | AD/AR | 24 | 99 |
KLHL24 | Простой буллезный эпидермолиз, генерализованный, с рубцеванием и выпадением волос, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП) | AD/AR | 5 | 5 |
KRT1 | Ладонно-подошвенная кератодермия, неэпидермолитическая, Ихтиоз, циклический, с эпидермолитическим гиперкератозом, Эпидермолитический гиперкератоз, Ихтиоз хистрикс, Керта-Маклина, Ладонно-подошвенный полосатый кератоз, Ладонно-подошвенная кератодермия, эпидермолитическая | AD | 24 | 63 |
KRT14 | Простой буллезный эпидермолиз, синдром Доулинга-Меара, простой буллезный эпидермолиз, ретикулярная пигментная дерматопатия, простой буллезный эпидермолиз, Вебер-Кокейн, простой буллезный эпидермолиз, синдром Кебнера, синдром Негели-Франческетти-Ядассона | AD/AR | 30 | 116 |
KRT5 | Простой буллезный эпидермолиз, болезнь Доулинга-Меара, болезнь Доулинга-Дегоса, простой буллезный эпидермолиз с мигрирующей кольцевидной эритемой, простой буллезный эпидермолиз с пятнистой пигментацией, простой буллезный эпидермолиз, болезнь Вебера-Коккейна, простой буллезный эпидермолиз, болезнь Кебнера, простой буллезный эпидермолиз, аутосомно-рецессивный | AD/AR | 38 | 152 |
LAMA3 | Буллезный эпидермолиз, узловой, Herlitz, буллезный эпидермолиз, генерализованный атрофический доброкачественный, ларингоонихокожный синдром | AR | 88 | 55 |
LAMB3 | Несовершенный амелогенез, буллезный эпидермолиз, соединительный, Herlitz, буллезный эпидермолиз, соединительный, не Herlitz | AD/AR | 84 | 118 |
LAMC2 | Буллезный эпидермолиз, узловой, Herlitz, Буллезный эпидермолиз, узловой, не Herlitz | AR | 55 | 41 |
PKP1 | Эктодермальная дисплазия/синдром хрупкости кожи | AR | 5 | 18 |
PLEC | Мышечная дистрофия, конечностно-поясная, буллезный эпидермолиз | AD/AR | 36 | 103 |
TGM5 | Синдром шелушения кожи | AR | 10 | 25 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.