Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель из 22 генов, которая включает оценку некодирующих вариантов. Идеально подходит для пациентов с заячьей губой и/или расщелиной неба, особенно для тех, у кого есть положительный семейный анамнез по расщелинам или у кого есть подозрение на ассоциированный генетический синдром.
Расщелины губы и неба являются распространенными врожденными дефектами. Заячья губа с расщелиной неба или без нее встречается у 1/700–1/1000 новорожденных, а расщелина неба встречается примерно у 1/1500 новорожденных. В большинстве случаев возникают как изолированные пороки развития, но они могут быть частью нескольких генетических синдромов или хромосомных аномалий. Этиология несиндромальных расщелин остается плохо изученной, и предполагается многофакторное наследование, но в некоторых семьях предрасположенность к расщелинам может следовать по аутосомно-доминантному типу наследования с различной пенетрантностью. Есть много синдромов, которые могут иметь расщелины как признак. Синдром Ван дер Вуда вызывается патогенной мутацией в IRF6 или GRHL3 и характеризуется расщелиной губы с расщелиной неба или без нее или изолированной расщелиной неба и парамедианными ямками на нижней губе. Это следует за аутосомно-доминантным наследованием, но пенетрантность является неполной. Расщелина неба может быть признаком синдрома Стиклера, также известного как наследственная артроофтальмопатия, наследственная витреоретинопатия, характеризующаяся ассоциацией глазных симптомов с аномалиями головы и лица, нарушениями костей и нейросенсорной глухотой. Синдром Стиклера, вызванный мутациями в COL2A1, COL11A1 или COL11A2, наследуется по аутосомно-доминантному типу. Аутосомно-рецессивный синдром Стиклера встречается редко и вызывается двуаллельными мутациями в COL9A1, COL9A2 и COL9A3. Синдром Кабуки представляет собой синдром множественных врожденных аномалий, характеризующийся типичными чертами лица, аномалиями скелета, умственной отсталостью от легкой до умеренной степени и задержкой постнатального роста. Другие результаты могут включать расщелины губы и/или неба. Синдром Кабуки вызывается мутациями в KMT2D или KDM6A.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ARHGAP29 | AD | 3 | 19 | |
COL11A1 | Синдром Маршалла, фиброхондрогенез, синдром Стиклера 2 типа | AD/AR | 34 | 94 |
COL11A2 | синдром Вейсенбахера-Цвеймюллера, глухота, отоспондиломегаэпифизарная дисплазия, фиброхондрогенез, синдром Стиклера 3 типа (неокулярный) | AD/AR | 29 | 57 |
COL2A1 | Аваскулярный некроз головки бедренной кости, регматогенная отслойка сетчатки, эпифизарная дисплазия с миопией и глухотой, чешская дисплазия, ахондрогенез 2 типа, платиспондилическая дисплазия типа Торранса, гипохондрогенез, врожденная спондилоэпифизарная дисплазия (ВЭДК), спондилоэпиметафизарная дисплазия (СЭМД) типа Струдвика, дисплазия Книста, Спондилопериферическая дисплазия, СЭД легкой степени с преждевременным началом артроза, СЭД с укорочением плюсневых костей, синдром Стиклера 1 типа | AD | 180 | 561 |
COL9A1 | Множественная эпифизарная дисплазия 6 типа (ЭДМ6), синдром Стиклера, тип IV | AD/AR | 9 | 6 |
COL9A2 | Синдром Стиклера, множественная эпифизарная дисплазия 2 типа (EDM2) | AD/AR | 7 | 12 |
COL9A3 | Множественная эпифизарная дисплазия 3 типа (ЭДМ3), рецессивный тип синдрома Стиклера | AD/AR | 10 | 14 |
CTNND1 | Блефарохейлодонтический синдром 2, Заячья губа | AD | 4 | 16 |
FOXE1 | Рак щитовидной железы, немедуллярный 4, Гипотиреоз, тиреоидный, с колючими волосами и расщелиной неба (синдром Бэмфорта-Лазаруса), Врожденный гипотиреоз | AD/AR | 4 | 23 |
GRHL3 | синдром ван дер Вуда 2 | AD | 12 | 27 |
IRF6 | Орофациальная расщелина, синдром подколенного птеригиума, синдром Ван дер Вуда | AD | 45 | 338 |
KDM6A | Синдром Кабуки | XL | 40 | 69 |
KMT2D | Синдром Кабуки | AD | 350 | 670 |
MSX1 | Орофациальная расщелина 5, Агенезия зубов, селективная, 1, с/без орофациальной расщелины, синдром Виткопа | AD | 11 | 48 |
SATB2 | Синдром стекла | AD | 62 | 106 |
SPECC1L | Расщелина лица, косая, 1, синдром Opitz GBBB, тип II | AD | 7 | 8 |
TBX2 | AD | 1 | 12 | |
TBX22 | Расщелина неба с анкилоглоссией или без нее | XL | 12 | 29 |
TGDS | синдром Катель-Манцке | AR | 6 | 7 |
TP63 | Синдром Раппа-Ходжкина, Орофациальная расщелина, ВЗРОСЛЫЙ синдром, Эктродактилия, эктодермальная дисплазия и синдром расщелины губы/неба, Анкилоблефарон-эктодермальные дефекты-заячья губа/нёбо, Расщепленная кисть/нога, Синдром конечности-молочной железы | AD | 59 | 122 |
TXNL4A | Синдром Берна-МакКеуна | AR | 19 | 13 |
ZSWIM6 | Акрометический лобно-носовой дизостоз | AD | 4 | 2 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.