Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель врожденных нарушений обмена моно- и дисахаридов - это панель из 9 генов, включающая оценку некодирующих вариантов.
Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на врожденные моно- или дисахаридные нарушения. Гены на этой панели включены в Расширенную панель метаболизма.
Неблагоприятные пищевые реакции представляют собой актуальную проблему в повседневной клинической практике, но плохо распознаются и решаются. Они распространены в промышленно развитых странах, где, в зависимости от методов сбора данных и определений, они затрагивают до 20% населения в целом. Непереносимость углеводов является наиболее распространенным типом неиммунно-опосредованной пищевой реакции. Непереносимость углеводов с ранним началом и генетической причиной включает врожденный дефицит сахаразы-изомальтазы, мальабсорбцию глюкозы-галактозы и врожденный дефицит лактазы. В Панель также включен ген наследственной непереносимости фруктозы (ALDOB), который характеризуется метаболическими нарушениями (гипогликемия, лактоацидемия, гипофосфатемия, гиперурикемия, гипермагниемия, гипераланинемия) и клиническими проявлениями (тошнота, рвота и расстройство желудка, хроническая задержка роста, задержка в развитии) после диетического воздействия фруктозы, сахарозы или сорбита. Также включены гены генетических гипергалактоземий (GALT, GALK, GALE). По результатам программ скрининга новорожденных распространенность классической галактоземии составляет 1:48 000. Синдром Фанкони-Биккеля, вызванный патогенными мутациями в SLC2A2, представляет собой редкое, но четко определенное клиническое заболевание, характеризующееся накоплением гепаторенального гликогена, дисфункцией проксимальных почечных канальцев и нарушением утилизации глюкозы и галактозы.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ALDOB | Непереносимость фруктозы, наследственная | AR | 41 | 67 |
GALE | Дефицит галактозоэпимеразы | AR | 12 | 26 |
GALK1 | Дефицит галактокиназы | AR | 15 | 44 |
GALT | Галактоземия | AR | 238 | 330 |
LCT | Дефицит лактазы | AR | 11 | 15 |
SI | Дефицит сахаразы-изомальтазы, врожденный | AR | 12 | 23 |
SLC2A1 | Криогидроцитоз с дефицитом стоматина с неврологическими дефектами, эпилепсия, идиопатическая генерализованная, синдром дефицита GLUT1 | AD/AR | 106 | 275 |
SLC2A2 | Болезнь накопления гликогена, синдром Фанкони-Биккеля, неонатальный сахарный диабет. | AR | 24 | 73 |
SLC5A1 | Мальабсорбция глюкозы/галактозы | AR | 3 | 58 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.