Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель Деменция представляет собой панель из 58 генов, которая включает оценку некодирующих вариантов, делеции и дупликации. Кроме того, он также включает наследуемый по материнской линии митохондриальный геном.
Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на деменцию.
Гаплотип APOE E4/E4 сообщается, если он идентифицирован этой панелью.
Деменция - это синдром, который включает в себя ухудшение когнитивных функций, таких как память, внимание, мышление и ориентация. Наследственные факторы могут играть роль в развитии некоторых форм деменции.
Например, наследственные формы болезни Альцгеймера связаны с мутациями в гене APP, гене PSEN1 или гене PSEN2. Эти гены участвуют в производстве бета-амилоида, белка, который образует пластинки в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера. Болезнь Альцгеймера наследуется аутосомно-доминантно, что означает, что если один из родителей имеет мутацию в гене, каждый ребенок имеет 50% риск унаследовать мутацию и развить болезнь.
Другие формы деменции, такие как болезнь Пика и болезнь Крейцфельдта-Якоба, также наследуются в автосомно-доминантном режиме. Однако, эти формы деменции являются гораздо более редкими, чем болезнь Альцгеймера.
Лобно-височная деменция представляет собой клинически и патологически гетерогенную группу деменций, не связанных с болезнью Альцгеймера, характеризующихся селективной прогрессирующей корковой атрофией, затрагивающей лобные или височные доли. Лобно-височная деменция встречается значительно реже, чем болезнь Альцгеймера, с оценками распространенности в популяции от 4 до 5 случаев на 100 000 человек в возрасте до 65 лет. Возраст начала обычно приходится на шестое десятилетие жизни. Однако это может начаться как в 30 лет, так и в 90. Приблизительно 20-50% людей с лобно-височной деменцией имеют пораженных родственников первой степени родства. ЛВД имеет значительный генетический компонент с аутосомно-доминантным или сцепленным с Х-хромосомой типом наследования. Подсчитано, что 10% пациентов с ЛВД имеют заболевание, вызывающее мутацию в одном гене.
Гаплотип APOE E4 представляет значительный риск деменции, связанной с болезнью Альцгеймера, особенно в гомозиготном состоянии. Следовательно, этот гаплотип сообщается на этой панели, если он обнаружен в гомозиготном состоянии.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCA7 | болезнь Альцгеймера | AD | 1 | 139 |
APOE | Гистиоцитарная болезнь цвета морской волны, дисбеталипопротеинемия, семейная (гиперлипопротеинемия), липопротеиновая гломерулопатия | AD/AR | 31 | 55 |
APP | Болезнь Альцгеймера, Церебральная амилоидная ангиопатия | AD/AR | 18 | 100 |
CHMP2B | Боковой амиотрофический склероз, связанный с CHMP2B, лобно-височная деменция | AD | 6 | 21 |
CSF1R | Лейкоэнцефалопатия, диффузная наследственная, со сфероидами | AD | 56 | 83 |
FUS | Боковой амиотрофический склероз, Эссенциальный тремор | AD/AR | 22 | 111 |
GRN | Лобно-височная долевая дегенерация с включениями TDP43, связанная с GRN, нейрональный цероидный липофусциноз | AD/AR | 43 | 214 |
MAPT | Болезнь Пика, лобно-височная деменция, синдром Паркинсона-деменция, надъядерный паралич, прогрессирующий | AD/AR | 26 | 104 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная оптическая невропатия Лебера, атаксия и полинейропатия, с началом во взрослом возрасте, кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая, синдром Ли, стриатонигральная дегенерация, инфантильная, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофическая и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная оптическая нейропатия Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром с оксидазы, наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Диабет-синдром глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, нефропатия, тубулоинтерстициальная, энцефалопатия, митохондриальная, эпилепсия, митохондриальная, миопатия, митохондриальная, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, диабет-синдром глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС, восприимчивость к | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Ли, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 4 | |
PRNP | Деменция, тельца Леви, болезнь Крейтцфельдта-Якоба, болезнь Гентингтона, болезнь Герстманна-Штраусслера, губчатая энцефалопатия с психоневрологическими признаками, бессонница, фатальные семейные | AD/AR | 26 | 104 |
PSEN1 | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), обратные угри, семейная, 3, деменция, лобно-височная, болезнь Пика, болезнь Альцгеймера | AD | 57 | 306 |
PSEN2 | Перинатальная/связанная с беременностью кардиомиопатия, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), болезнь Альцгеймера, 4 | AD | 9 | 60 |
RNF216 | Мозжечковая атаксия и гипогонадотропный гипогонадизм (синдром Гордона Холмса) | AR | 10 | 14 |
SIGMAR1 | Боковой амиотрофический склероз, Спинальная мышечная атрофия, дистальная, Лобно-височная долевая дегенерация-заболевание двигательных нейронов | AR | 6 | 14 |
SNCA | Болезнь Паркинсона, деменция с тельцами Леви | AD | 7 | 35 |
SORL1 | Болезнь Альцгеймера с ранним началом | AD | 3 | 134 |
TARDBP | Боковой амиотрофический склероз | AD | 20 | 69 |
TREM2 | Болезнь Насу-Хакола, Деменция с ранним началом без костных кист, Поликистозная липомембранозная остеодисплазия со склерозирующей лейкоэнцефалопатией | AR | 14 | 48 |
TUBA4A | Боковой амиотрофический склероз 22 | AD | 6 | 13 |
UBE3A | Синдром Ангельмана | AD | 176 | 202 |
UBQLN2 | Боковой амиотрофический склероз | XL | 5 | 31 |
VCP | Боковой амиотрофический склероз, миопатия с тельцами включения с ранним началом болезни Педжета, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 17 | 61 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.