Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Болезнь Гиршпрунга входит 15 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на болезнь Гиршпрунга или родственное заболевания.
Болезнь Гиршпрунга (HSCR), или врожденный кишечный аганглионоз, представляет собой врожденный дефект, характеризующийся полным отсутствием нейрональных ганглиозных клеток в части кишечного тракта. Нервные клетки имеют решающее значение для функционирования толстой кишки, поскольку они контролируют регулярные мышечные сокращения, которые обеспечивают перемещение пищи через кишечник. При HSCR аганглионарный сегмент включает дистальную часть прямой кишки и прилежащую проксимальную кишку различной длины. У 80% людей аганглионоз ограничивается ректосигмовидной кишкой (болезнь короткого сегмента), у 15-20% он распространяется проксимальнее сигмовидной кишки (болезнь длинного сегмента) и примерно у 5% аганглионоз поражает всю толстую кишку (тотальный толстокишечный аганглионоз). У больных детей обычно наблюдается нарушение перистальтики кишечника, например, нарушение выделения мекония в течение первых 48 часов жизни, запор, рвота, боль или вздутие живота, а иногда и диарея в первые два месяца жизни. Однако при более легких формах первоначальный диагноз HSCR может быть отложен до позднего детства или взрослой жизни, и поэтому HSCR следует рассматривать у любого человека, страдающего тяжелыми запорами на протяжении всей жизни. Лица с HSCR подвержены риску энтероколита и/или потенциально смертельной перфорации кишечника. HSCR считается нейрокристопатией, заболеванием клеток и тканей, происходящих из нервного гребня, и может возникать как изолированное явление или как часть мультисистемного заболевания. Признаны как синдромальные, так и несиндромальные причины HSCR. Примерно у трети детей с болезнью Гиршпрунга наблюдаются поражения других систем органов. Примерами моногенных синдромальных форм HSCR (охваченных этой панелью) являются синдром Ваарденбурга типа 4 (аутосомно-рецессивное заболевание, вызванное EDNRB, мутации EDN3, при которых HSCR является частым, и аутосомно-доминантная форма с мутациями SOX10, при которых HSCR присутствует почти в 100% случаев). случаев), синдром Мовата-Уилсона (мутации в ZEB2, HSCR присутствуют в 41-71% случаев) и множественная эндокринная неоплазия типа 2 (MEN 2A и 2B) (мутации в RET). Примерно 50% семейных случаев HSCR являются гетерозиготными по мутациям RET, однако пенетрантность этих мутаций составляет только 50–70%, зависит от пола и варьируется в зависимости от степени аганглионоза. Заболеваемость HSCR составляет примерно 1/5000 живорождений, но она варьируется в разных популяциях.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
BDNF | Синдром центральной гиповентиляции, врожденный | AD | 1 | 23 |
CELSR3 | болезнь Гиршпрунга | AD | 25 | |
EDN3 | Болезнь Гиршпрунга, синдром центральной гиповентиляции, врожденный, синдром Ваарденбурга | AD/AR | 7 | 21 |
EDNRB | Болезнь Гиршпрунга, синдром ABCD, синдром Ваарденбурга. | AD/AR | 12 | 66 |
KIF1BP | Синдром мегаколона Гольдберга-Шпринтцена | AR | 7 | 10 |
L1CAM | Умственная отсталость, афазия, синдром шаркающей походки и отведенных больших пальцев (MASA), гидроцефалия вследствие врожденного стеноза сильвиева водопровода, спастический синдром, синдром CRASH, мозолистое тело, частичная агенезия | XL | 80 | 292 |
MITF | Синдром альбинизма-глухоты Титца, синдром Ваарденбурга, колобома, остеопетроз, микрофтальмия, макроцефалия, альбинизм и глухота (COMMAD) | AD/AR | 32 | 58 |
NRG1 | Несиндромальная болезнь Гиршпрунга | AD/AR | 1 | 10 |
NRTN | болезнь Гиршпрунга | AD | 2 | |
PAX3 | Синдром черепно-лицевой глухоты, синдром Ваарденбурга, тип 1, синдром Ваарденбурга, тип 3 | AD/AR | 54 | 149 |
PHOX2B | Синдром центральной гиповентиляции, врожденный, нейробластома, предрасположенность к нейробластоме с болезнью Гиршпрунга | AD | 11 | 86 |
RET | Болезнь Гиршпрунга, синдром центральной гиповентиляции, врожденный, феохромоцитома, медуллярный рак щитовидной железы, множественная эндокринная неоплазия | AD | 122 | 407 |
RMRP | Хрящно-волосяная гипоплазия, Метафизарная дисплазия без гипотрихоза, Анауксетическая дисплазия | AR | 87 | 123 |
SOX10 | Периферическая демиелинизирующая нейропатия, центральная дисмиелинизация, синдром Ваарденбурга и болезнь Гиршпрунга, синдром Каллмана | AD | 56 | 148 |
ZEB2 | Синдром Мовата-Вильсона | AD | 154 | 287 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.