Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Кардиомиопатия гипертрофическая входит 92 гена, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций, а также митохондриальный геном.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на кардиомиопатию гипертрофическую или имеющие гипертрофию левого желудочка без высокого кровяного давления или аортального стеноза в анамнезе.
Гипертрофическая кардиомиопатия является одним из наиболее распространенных моногенных заболеваний человека с распространенностью 1:500. Это также наиболее частая причина внезапной сердечной смерти среди молодых людей. Гипертрофическая кардиомиопатия обычно определяется развитием необъяснимой гипертрофии левого желудочка и обычно вызывается мутациями в генах кардиального саркомера. При гипертрофической кардиомиопатии гипертрофии левого желудочка возникает в недилатированном желудочке при отсутствии других сердечных или системных заболеваний, способных вызвать наблюдаемую аномальную толщину стенки левого желудочка. Системные заболевания, которые могут имитировать гипертрофическую кардиомиопатию, включают, например, перегрузку давлением из-за длительно существующей гипертензии или аортального стеноза, или накопительные/инфильтративные нарушения (болезнь Фабри, болезнь Помпе) или определенные синдромы (болезни спектра Нунана, болезнь Данона). Клинические проявления варьируют от бессимптомной гипертрофии левого желудочка до прогрессирующей сердечной недостаточности, желудочковых аритмий и внезапной сердечной смерти. Также могут проявляться мерцательная аритмия и нарушения атриовентрикулярной проводимости. Гипертрофическая кардиомиопатия является наиболее частой причиной внезапной сердечной смерти в возрасте до 30 лет, а также наиболее частой причиной внезапной сердечной смерти у спортсменов. Внезапная сердечная смерть может быть первым клиническим проявлением даже у пациентов без выраженной гипетрофии левого желудочка. Симптомы могут варьироваться от человека к человеку, даже в пределах одной семьи. Общие симптомы включают одышку (особенно во время физической нагрузки), боль в груди, сердцебиение, ортостаз, предобморочное состояние и обмороки. Чаще всего гипертрофия левого желудочка при гипертрофической кардиомиопатии проявляется в подростковом или юношеском возрасте, хотя может развиться и в более позднем возрасте, в младенчестве или в детстве.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCC9 | Мерцательная аритмия, синдром Канту, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 27 | 46 |
ACAD9 | Семейство ацил-КоА-дегидрогеназ, дефицит | AR | 26 | 61 |
ACADVL | Ацил-КоА-дегидрогеназа, очень длинная цепь, дефицит | AR | 119 | 282 |
ACTA1 | Миопатия | AD/AR | 68 | 212 |
ACTC1 | Неуплотнение левого желудочка, гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), кардиомиопатия, рестриктивная, дефект межпредсердной перегородки, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 23 | 63 |
ACTN2 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 11 | 44 |
AGK | Синдром Сенгера, Катаракта 38 | AR | 18 | 27 |
AGL | Болезнь накопления гликогена | AR | 142 | 245 |
ALPK3 | Детская кардиомиопатия | AR | 12 | 6 |
APOA1 | Амилоидоз, системный ненейронопатический, гипоальфалипопротеинемия | AD/AR | 28 | 71 |
BAG3 | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), миопатия, миофибриллярная | AD | 39 | 62 |
BRAF | синдром LEOPARD, синдром Нунан, кожно-кардиальный синдром | AD | 134 | 65 |
CACNA1C | Синдром Бругада, синдром Тимоти, нарушение развития нервной системы | AD | 19 | 68 |
CBL | Расстройство, подобное синдрому Нунана, с ювенильным миеломоноцитарным лейкозом или без него | AD | 24 | 43 |
COX15 | Синдром Лея, кардиоэнцефаломиопатия, фатальный младенческий, из-за дефицита цитохром-с-оксидазы | AR | 7 | 5 |
CPT2 | Дефицит карнитинпальмитоилтрансферазы II | AR | 72 | 111 |
CSRP3 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 4 | 30 |
DES | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), миопатия, миофибриллярная, лопаточно-перонеальный синдром, нейрогенная, типа Кайзера | AD/AR | 64 | 124 |
ELAC2 | Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования 17 | AR | 11 | 15 |
EPG5 | синдром Вичи | AR | 36 | 66 |
FBXL4 | Синдром истощения митохондриальной ДНК | AR | 55 | 47 |
FHL1 | Миопатия с постуральной мышечной атрофией, мышечная дистрофия Эмери-Дрейфуса, редукционная миопатия тела | XL | 26 | 62 |
FHOD3 | Кардиомиопатия, семейная гипертрофическая | AD | 1 | |
FLNC | Миопатия | AD | 54 | 109 |
FXN | атаксия Фридрейха | AR | 13 | 63 |
GAA | Болезнь накопления гликогена | AR | 193 | 573 |
GLA | Болезнь Фабри | XL | 226 | 937 |
GSK3B | Гипертрофическая кардиомиопатия, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | 2 | ||
HRAS | Синдром Костелло, врожденная миопатия с избытком мышечных веретен | AD | 43 | 31 |
JPH2 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП) | AD | 3 | 13 |
KLHL24 | Простой буллезный эпидермолиз, генерализованный, с рубцеванием и выпадением волос, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП) | AD/AR | 5 | 5 |
KRAS | синдром Нунана, кожно-сердечный синдром | AD | 63 | 35 |
LAMP2 | Данон болезнь | XL | 62 | 101 |
MAP2K1 | Кардио-кожный синдром | AD | 45 | 23 |
MAP2K2 | Кардио-кожный синдром | AD | 21 | 35 |
MIPEP | Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования 31 | AR | 5 | 8 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная оптическая невропатия Лебера, атаксия и полинейропатия, с началом во взрослом возрасте, кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая, синдром Ли, стриатонигральная дегенерация, инфантильная, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофическая и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная оптическая нейропатия Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром с оксидазы, наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Диабет-синдром глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, нефропатия, тубулоинтерстициальная, энцефалопатия, митохондриальная, эпилепсия, митохондриальная, миопатия, митохондриальная, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, диабет-синдром глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС, восприимчивость к | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Ли, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 4 | |
MTO1 | Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования | AR | 16 | 24 |
MYBPC3 | Неуплотнение левого желудочка, гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 482 | 1048 |
MYH7 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), миопатия, накопление миозина, дистальная миопатия, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 305 | 986 |
MYL2 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), инфантильная болезнь мышечных волокон I типа и кардиомиопатия | AD | 21 | 67 |
MYL3 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП) | AD/AR | 12 | 41 |
NDUFAF2 | Дефицит митохондриального комплекса I, синдром Ли | AR | 9 | 8 |
PLN | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD/AR | 8 | 30 |
PRKAG2 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Вольфа-Паркинсона-Уайта, болезнь накопления гликогена в сердце, врожденный летальный исход | AD | 19 | 57 |
PTPN11 | Синдром Нунана, метахондроматоз | AD | 135 | 140 |
RAF1 | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 45 | 53 |
RIT1 | Нунан синдром | AD | 23 | 26 |
SLC25A4 | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия с делециями митохондриальной ДНК, синдром истощения митохондриальной ДНК | AD/AR | 12 | 14 |
SOS1 | Нунан синдром | AD | 44 | 71 |
TNNC1 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 9 | 24 |
TNNI3 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), Кардиомиопатия, рестриктивная, Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD/AR | 56 | 129 |
TNNT2 | Неуплотнение левого желудочка, гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), кардиомиопатия, рестриктивная, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 61 | 148 |
TPM1 | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 34 | 98 |
TTR | Дистранстиретинемическая гипертироксинемия, амилоидоз, наследственный, связанный с транстиретином | AD | 52 | 148 |
VCL | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 8 | 30 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.