Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Панель вродженного амавроза Лебера входит 65 генов, оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций, а также митохондриальный геном.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на вродженный амавроз Лебера или родственное заболевания.
Врожденный амавроз Лебера — тяжелая дистрофия сетчатки, приводящая к слепоте или тяжелым нарушениям зрения в возрасте до 1 года. На его долю приходится 10-18% врожденной слепоты и 5% всех дистрофий сетчатки. Врожденный амавроз Лебера клинически характеризуется ухудшением зрительной функции, часто сопровождающимся нистагмом, аномальными зрачковыми реакциями, светобоязнью, высокой дальнозоркостью, заметным снижением электроретинограммы и кератоконусом. Характерным признаком является окуло-цифровой симптом Франческетти, включающий тыканье в глаза, надавливание и трение. Врожденный амавроз Лебера является генетически гетерогенным заболеванием и обычно наследуется по аутосомно-рецессивному типу. Сообщалось о редких доминантных случаях. Недавние клинические испытания заместительной терапии RPE65 показали многообещающую эффективность в улучшении зрения у пациентов с врожденным амаврозом Лебера, связанным с RPE65 (PMID: 23341635). Распространенность врожденного амавроза Лебера составляет от 1:50 000 до 1:33 000.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AIPL1 | Пигментный ретинит, колбочковая дистрофия, врожденный амавроз Лебера. | AR | 10 | 79 |
ALMS1 | синдром Альстрема | AR | 197 | 302 |
BBS4 | Синдром Барде-Бидля | AR | 25 | 53 |
CABP4 | Куриная слепота врожденная стационарная | AR | 6 | 11 |
CEP290 | Синдром Барде-Бидля, врожденный амавроз Лебера, синдром Жубера, синдром Сениора-Локена, синдром Меккеля | AR | 130 | 289 |
CNGA3 | Врожденный амавроз Лебера, ахроматопсия | AR | 32 | 149 |
CRB1 | Пигментный ретинит, пигментная паравенозная хориоретинальная атрофия, врожденный амавроз Лебера | AR | 54 | 334 |
CRX | Дистрофия колбочек, врожденный амавроз Лебера. | AD/AR | 30 | 106 |
CWC27 | Пигментный ретинит с аномалиями скелета или без них (RPSKA) | AR | 5 | 7 |
DTHD1 | Врожденный амавроз Лебера с мышечной дистрофией | AR | 1 | |
GUCY2D | Дистрофия колбочек, врожденный амавроз Лебера. | AD/AR | 34 | 235 |
IDH3A | Лебер врожденный амавроз | AR | 7 | |
IMPDH1 | Пигментный ретинит, врожденный амавроз Лебера. | AD | 7 | 23 |
IQCB1 | Синдром Сениора-Локена | AR | 24 | 41 |
KCNJ13 | Витреоретинальная дегенерация «снежинка», врожденный амавроз Лебера | AD/AR | 6 | 10 |
LCA5 | Лебер врожденный амавроз | AR | 10 | 49 |
LRAT | Пигментный ретинит, ювенильный, врожденный амавроз Лебера, точечный белый ретинит, дистрофия сетчатки, тяжелое раннее начало | AR | 8 | 23 |
MERTK | Пигментный ретинит | AR | 25 | 75 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера, атаксия и полинейропатия, начало у взрослых, кардиомиопатия, детская гипертрофическая, синдром Лея, стриатонигральная дегенерация, детская, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофия и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофия | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с-оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия зрительного нерва Лебера и дистония | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и эпизоды, подобные инсульту. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Синдром диабетической глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, Нефропатия, тубулоинтерстициальная, Энцефалопатия, митохондриальная, Эпилепсия, митохондриальная, Миопатия, митохондриальная, Митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, синдром диабетической глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС, восприимчивость к | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами. | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | синдром Лея, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая внешняя офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальной миопатией, энцефалопатией, лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами. | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | синдром Лея, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 4 | |
MYO7A | Глухота аутосомно-доминантный 11, Синдром Ушера I тип, Глухота аутосомно-рецессивный 2 | AD/AR | 239 | 515 |
NMNAT1 | Лебер врожденный амавроз | AR | 20 | 74 |
RD3 | Лебер врожденный амавроз | AR | 5 | 13 |
RDH12 | Пигментный ретинит, врожденный амавроз Лебера. | AD/AR | 23 | 102 |
RDH5 | Белоточечное дно | AR | 11 | 51 |
RPE65 | Пигментный ретинит, врожденный амавроз Лебера. | AD/AR | 31 | 197 |
RPGRIP1 | Дистрофия колбочек, врожденный амавроз Лебера. | AR | 44 | 145 |
SPATA7 | Лебер врожденный амавроз, пигментный ретитинит | AR | 15 | 39 |
TUBB4B | Врожденный амавроз Лебера, потеря слуха | AD | 2 | 3 |
TULP1 | Пигментный ретинит, врожденный амавроз Лебера. | AR | 24 | 74 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.