Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Наследственный рак" входит 160 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций (ХМА).
Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на наследственную предрасположенность к раку. Эта панель предназначена для выявления наследственных мутаций и не должна использоваться для выявления соматических мутаций в опухолевой ткани.
Синдромы наследственного рака составляют примерно 5-10% всех онкологических заболеваний. Эти виды рака происходят из желудочно-кишечного тракта, эндокринной и нейроэндокринной систем или из различных органов, таких как легкие, почки, печень, поджелудочная железа, кожа и глаза. Подозрение на наследственный рак возникает при наличии нескольких родственников с одной стороны семьи с одинаковыми или родственными формами рака, раком в раннем возрасте или множественными первичными раками у человека.
Наиболее распространенными наследственными раковыми синдромами являются наследственный синдром рака молочной железы и яичников, синдром Линча (также известный как наследственный неполипозный колоректальный рак), синдром Ли-Фраумени, синдром опухоли гамартомы PTEN, семейный аденоматозный полипоз, синдром фон-Хиппеля Линдау и множественный полипоз, эндокринная неоплазия типа 1 и типа 2. Большинство наследственных раковых синдромов наследуются по аутосомно-доминантному типу, пенетрантностью высокая.
Генетическое тестирование является наиболее эффективным способом выявления лиц с генетической предрасположенностью к развитию рака. Точная генетическая диагностика позволяет оценить личный риск развития рака, а унаследованный генетический вариант может быть принят во внимание при планировании лечения и последующем наблюдении как здоровых, так и больных людей. В большинстве случаев смертность от рака может быть значительно снижена у лиц с высоким риском путем регулярного наблюдения и профилактических стратегий.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AIP | Аденома гипофиза, семейная изолированная | AD | 53 | 110 |
ALK | Нейробластома | AD | 31 | 15 |
ANKRD26 | Тромбоцитопения | AD | 6 | 21 |
APC | Синдром Гарднера, Десмоидная болезнь, наследственная, Семейный аденоматозный полипоз | AD | 773 | 1926 |
ATM | Рак молочной железы, атаксия-телеангиэктазия | AD/AR | 1047 | 1109 |
AXIN2 | Синдром олигодонтия-колоректального рака, Oligondontia, изолированный | AD | 19 | 18 |
BAP1 | Синдром опухолевой предрасположенности | AD | 74 | 113 |
BARD1 | Рак молочной железы | AD | 159 | 114 |
BLM | Синдром Блума | AR | 152 | 119 |
BMPR1A | полипоз, ювенильный кишечный | AD | 110 | 140 |
BRAF | синдром LEOPARD, синдром Нунана, кожно-кардиальный синдром | AD | 134 | 65 |
BRCA1 | Рак поджелудочной железы, рак молочной железы и яичников, семейный | AD | 2997 | 2631 |
BRCA2 | Анемия Фанкони, медуллобластома, предрасположенность к глиоме, рак поджелудочной железы, опухоль Вильмса, рак молочной железы и яичников, семейная | AD/AR | 3369 | 2659 |
BRIP1 | Анемия Фанкони, Рак молочной железы | AD/AR | 238 | 189 |
BUB1B | Синдром мозаичной пестрой анеуплоидии, признак преждевременного разделения хроматид | AD/AR | 14 | 28 |
CBL | Расстройство, подобное синдрому Нунана, с ювенильным миеломоноцитарным лейкозом или без него | AD | 24 | 43 |
CD70 | Первичный иммунодефицит | AR | 4 | |
CDC73 | Карцинома, паращитовидная железа, гиперпаратиреоз, гиперпаратиреоз-синдром опухоли челюсти | AD | 50 | 101 |
CDH1 | Рак, связанный с CDH1, блефарохейлодонтический синдром 1 | AD | 178 | 242 |
CDK4 | Меланома, злокачественная опухоль кожи | AD | 4 | 14 |
CDKN1B | Множественная эндокринная неоплазия | AD | 13 | 20 |
CDKN1C | Синдром Беквита-Видеманна, синдром IMAGE | AD | 35 | 81 |
CDKN2A | Меланома семейная, синдром меланомы-рака поджелудочной железы | AD | 87 | 232 |
CEBPA | Острый миелоидный лейкоз, семейный | AD | 15 | 13 |
CEP57 | Синдром мозаичной пестрой анеуплоидии | AR | 5 | 5 |
CHEK2 | синдром Ли-Фраумени | AD/AR | 275 | 197 |
CTNNA1 | Макулярная дистрофия по типу 2 | AD | 6 | 10 |
CYLD | синдром Шпиглера-Брука, множественная трихоэпителиома, цилиндроматоз | AD | 34 | 106 |
DDB2 | пигментная ксеродерма | AR | 4 | 17 |
DDX41 | Семейные миелопролиферативные/лимфопролиферативные новообразования, множественные типы, восприимчивость к | AD | 9 | 21 |
DICER1 | синдром DICER1 | AD | 197 | 137 |
DIS3L2 | Синдром Перлмана | AR | 12 | 14 |
DKC1 | Синдром Хойераала-Хрейдарссона, врожденный дискератоз | XL | 48 | 74 |
EFL1 | Синдром Швахмана-Даймонда | 3 | 2 | |
EGFR | Рак легкого, семейный, восприимчивость к, Воспалительные заболевания кожи и кишечника, неонатальный, Острый миелоидный лейкоз, семейный | AD/AR | 55 | 18 |
ELANE | нейтропения | AD | 43 | 217 |
EPCAM | Диарея 5, с тафтинговой энтеропатией, врожденная, колоректальный рак, наследственный неполипоз | AD/AR | 38 | 80 |
ERCC1 | Цереброокулофациоскелетный синдром 4 | AR | 8 | 5 |
ERCC2 | Пигментная ксеродерма, трихотиодистрофия, светочувствительность, цереброокулофациоскелетный синдром 2 | AR | 26 | 98 |
ERCC3 | пигментная ксеродерма, трихотиодистрофия, светочувствительность | AR | 10 | 19 |
ERCC4 | Анемия Фанкони, пигментная ксеродерма, прогероидный синдром XFE | AR | 13 | 70 |
ERCC5 | Пигментная ксеродермия, пигментная ксеродерма/синдром Коккейна | AR | 21 | 54 |
ETV6 | Тромбоцитопения 5 | AD | 10 | 38 |
EXO1 | синдром Линча | AD/AR | 1 | 14 |
EXT1 | Множественные хрящевые экзостозы 1 | AD | 97 | 523 |
EXT2 | Множественные хрящевые экзостозы 2, Судороги, сколиоз и синдром макроцефалии | AD/AR | 45 | 250 |
EZH2 | Синдром Уивера | AD | 29 | 41 |
FAM111B | Наследственная фиброзирующая пойкилодермия с контрактурой сухожилий, миопатией и легочным фиброзом, рак легких, семейная, восприимчивость к | AD | 7 | 7 |
FANCA | анемия Фанкони | AR | 191 | 677 |
FANCB | анемия Фанкони | XL | 11 | 21 |
FANCC | анемия Фанкони | AR | 94 | 64 |
FANCD2 | анемия Фанкони | AR | 21 | 61 |
FANCE | анемия Фанкони | AR | 4 | 17 |
FANCF | Фанкониевая анемия | AR | 7 | 16 |
FANCG | анемия Фанкони | AR | 16 | 92 |
FANCI | анемия Фанкони | AR | 13 | 45 |
FANCL | анемия Фанкони | AR | 13 | 24 |
FANCM | анемия Фанкони | AR | 6 | 50 |
FH | Наследственный лейомиоматоз и почечно-клеточный рак | AD/AR | 178 | 207 |
FLCN | Синдром Берта-Хогга-Дюба, Пневмоторакс, первичный спонтанный | AD | 154 | 210 |
GALNT12 | Колоректальный рак, предрасположенность к 1, Воспалительные заболевания кишечника | AD | 8 | |
GATA2 | Миелодиспластический синдром, Хроническая нейтропения, ассоциированная с моноцитопенией, переходящая в миелодисплазию и острый миелоидный лейкоз, Острый миелоидный лейкоз, синдром Эмбергера, Иммунодефицит | AD | 30 | 142 |
GPC3 | Синдром Симпсона-Голаби-Бемеля | XL | 33 | 75 |
GPR101 | Аденома гипофиза, секретирующая гормон роста, 2 | XL | 17 | |
GREM1 | Синдром наследственного смешанного полипоза | AD/AR | 1 | 8 |
HAVCR2 | ||||
HNF1A | Сахарный диабет молодых с началом в зрелом возрасте, почечно-клеточная карцинома, непапиллярные светлоклеточные клетки, аденоматоз печени | AD | 78 | 528 |
HOXB13 | Семейный рак простаты | AD/AR | 1 | 5 |
HRAS | Синдром Костелло, врожденная миопатия с избытком мышечных веретен | AD | 43 | 31 |
IKZF1 | Иммунодефицит, общая переменная, 13 | AD | 10 | 35 |
KIF1B | Феохромоцитома, нейробластома, болезнь Шарко-Мари-Тута, тип 2А1 | AD | 7 | 12 |
KIT | Гастроинтестинальная стромальная опухоль, пьебалдизм | AD | 79 | 116 |
KITLG | Гиперпигментация с гипопигментацией или без нее, семейно-прогрессирующая, пигментация кожи/волос/глаз, вариации, 7 | AD | 6 | 10 |
KRAS | синдром Нунана, кожно-сердечный синдром | AD | 63 | 35 |
LZTR1 | Шванноматоз, синдром Нунан | AD/AR | 34 | 71 |
MAP2K1 | Кардио-кожный синдром | AD | 45 | 23 |
MAP2K2 | Кардио-кожный синдром | AD | 21 | 35 |
MAX | Феохромоцитома | AD | 13 | 31 |
MEN1 | Гиперпаратиреоз, семейный первичный, множественная эндокринная неоплазия | AD | 263 | 730 |
MET | Глухота, почечно-клеточная карцинома, папиллярная, костно-фиброзная дисплазия, восприимчивость к | AD/AR | 20 | 34 |
MITF | Синдром альбинизма-глухоты Титца, синдром Ваарденбурга, колобома, остеопетроз, микрофтальмия, макроцефалия, альбинизм и глухота (COMMAD) | AD/AR | 32 | 58 |
MLH1 | Синдром Мьюира-Торре, рак эндометрия, раковый синдром несоответствия репарации, колоректальный рак, наследственный неполипоз | AD/AR | 873 | 1191 |
MLH3 | Колоректальный рак, наследственный неполипоз, рак эндометрия | AD/AR | 7 | 31 |
MRE11A | Расстройство, подобное атаксии-телеангиэктазии-1 | AR | 57 | 56 |
MSH2 | Синдром Мьюира-Торре, рак эндометрия, колоректальный рак, наследственный неполипоз, синдром несоответствующей репарации рака | AD/AR | 933 | 1249 |
MSH3 | Эндометриальная карцинома, колоректальный аденоматозный полипоз, аутосомно-рецессивный, с пиломатрикомами | AD | 4 | 22 |
MSH6 | Рак эндометрия, раковый синдром несоответствия репарации, колоректальный рак, наследственный неполипоз | AD/AR | 672 | 586 |
MUTYH | Семейный аденоматозный полипоз, Колоректальный аденоматозный полипоз, с пиломатрикомами | AR | 134 | 168 |
NBN | Рак молочной железы, синдром разрыва Неймегена | AD/AR | 188 | 97 |
NF1 | синдром Ватсона, нейрофиброматоз, нейрофиброматоз-синдром Нунана | AD | 1157 | 2901 |
NF2 | Шванноматоз, нейрофиброматоз | AD | 66 | 433 |
NRAS | Нунан синдром | AD | 31 | 14 |
NSD1 | синдром Сотоса, синдром Уивера, синдром Беквита-Видеманна | AD | 329 | 517 |
NSUN2 | Синдром Дубовица, несиндромальная умственная отсталость | AR | 8 | 7 |
NTHL1 | Семейный аденоматозный полипоз 3 | AR | 7 | 3 |
PALB2 | Анемия Фанкони, Рак поджелудочной железы, Рак молочной железы | AD/AR | 495 | 406 |
PAX5 | Пре-В-клеточный острый лимфобластный лейкоз | AD | 7 | |
PDGFRA | Гастроинтестинальная стромальная опухоль | AD | 22 | 19 |
PHOX2B | Центральный гиповентиляционный синдром, врожденный, Нейробластома, предрасположенность, Нейробластома с болезнью Гиршпрунга | AD | 11 | 86 |
PMS1 | Наследственный неполипозный рак толстой кишки | AD/AR | 1 | 32 |
PMS2 | Синдром рака репарации несоответствия, колоректальный рак, наследственный неполипоз | AD/AR | 319 | 342 |
POLD1 | Колоректальный рак, гипоплазия нижней челюсти, глухота, прогероидные признаки и синдром липодистрофии, идиопатические бронхоэктазы, иммунодефицит | AD/AR | 3 | 31 |
POLE | Колоректальный рак, лицевой дисморфизм, иммунодефицит, ливедо и синдром низкого роста (синдром FILS) | AD/AR | 8 | 70 |
POLH | Пигментная ксеродерма, вариантный тип | AR | 20 | 78 |
POT1 | чувствительность к глиоме 9, меланома, злокачественная опухоль кожи, восприимчивость к 10 | AD | 2 | 34 |
PPM1D | Наследственный рак молочной железы | AD | 16 | 60 |
PRF1 | Лимфома, неходжкинская, апластическая анемия, начало у взрослых, гемофагоцитарный лимфогистиоцитоз | AR | 24 | 183 |
PRKAR1A | Миксома, внутрисердечная, Акродизостоз, Пигментно-узелковая болезнь коры надпочечников, Комплекс Карнея | AD | 75 | 183 |
PTCH1 | Синдром базально-клеточного невуса | AD | 193 | 522 |
PTEN | синдром Баннаяна-Райли-Рувалькаба, синдром Лермитта-Дюкло, синдром Каудена | AD | 435 | 638 |
PTPN11 | Синдром Нунана, метахондроматоз | AD | 135 | 140 |
RAD50 | Рак молочной железы, расстройство, подобное синдрому разрыва Неймегена | AD/AR | 183 | 88 |
RAD51C | Анемия Фанкони, рак молочной железы и яичников, семейная | AD/AR | 107 | 125 |
RAD51D | Рак яичников, семейный | AD | 77 | 78 |
RAF1 | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 45 | 53 |
RASA2 | Нунан синдром | AD | 1 | 3 |
RB1 | Ретинобластома | AD | 266 | 1102 |
RECQL | Рак молочной железы | AD | 9 | 27 |
RECQL4 | синдром Баллера-Герольда, синдром РАПАДИЛИНО, синдром Ротмунда-Томсона | AR | 82 | 114 |
REST | Фиброматоз десен, 5 | AD | 3 | 16 |
RET | Болезнь Гиршпрунга, синдром центральной гиповентиляции, врожденный, феохромоцитома, медуллярный рак щитовидной железы, множественная эндокринная неоплазия | AD/AR | 122 | 407 |
RHBDF2 | Тилоз при раке пищевода | AD | 2 | 4 |
RIT1 | Нунан синдром | AD | 23 | 26 |
RPS20 | Колоректальный рак | AD | 1 | |
RRAS | Нунан-синдром подобный фенотипу | AD/AR | 2 | |
RUNX1 | Нарушение тромбоцитов, семейное, с ассоциированным миелоидным злокачественным новообразованием | AD | 47 | 101 |
SAMD9 | синдром миража, опухолевой кальциноз, нормофосфатемия | AD/AR | 10 | 27 |
SAMD9L | Синдром атаксии-панцитопении | AD | 4 | 16 |
SBDS | Апластическая анемия, синдром Швахмана-Даймонда, тяжелая спондилометафизарная дисплазия | AR | 19 | 90 |
SDHA | Синдром Лея/дефицит митохондриального комплекса дыхательной цепи II, стромальная опухоль желудочно-кишечного тракта, параганглиомы, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), дилатационная кардиомиопатия, 1GG | AD/AR | 54 | 87 |
SDHAF2 | Параганглиомы | AD | 4 | 5 |
SDHB | Параганглиома и стромальная саркома желудка, Феохромоцитома, Стромальная опухоль желудочно-кишечного тракта, Параганглиомы, Кауден-подобный синдром | AD | 151 | 272 |
SDHC | Параганглиома и стромальная саркома желудка, Гастроинтестинальная стромальная опухоль, Параганглиомы | AD | 29 | 60 |
SDHD | Параганглиома и стромальная саркома желудка, феохромоцитома, параганглиомы, карциноидные опухоли кишечника, синдром Каудена, дефицит митохондриального комплекса II | AD | 68 | 170 |
SHOC2 | Нунаноподобный синдром с выпадением анагеновых волос | AD | 2 | 4 |
SLX4 | анемия Фанкони | AR | 18 | 72 |
SMAD4 | Ювенильный полипоз/синдром наследственной геморрагической телеангиэктазии, полипоз, ювенильный кишечный синдром, дисплазия Мире, наследственная геморрагическая телеангиэктазия | AD | 179 | 143 |
SMARCA4 | Синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям | AD | 76 | 57 |
SMARCB1 | Шванноматоз, синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям, синдром Коффина-Сириса 3 | AD | 36 | 118 |
SMARCE1 | Синдром Коффина-Сириса | AD | 14 | 12 |
SOS1 | Нунан синдром | AD | 44 | 71 |
SOS2 | Синдром Нунана 9 | AD | 4 | 6 |
SPRED1 | синдром Легиуса | AD | 38 | 71 |
SRP72 | Синдром недостаточности костного мозга 1 | AD | 2 | 5 |
STK11 | синдром Пейтца-Егерса | AD | 173 | 460 |
SUFU | Медуллобластома, синдром базально-клеточного невуса | AD | 22 | 44 |
TERC | Апластическая анемия, легочный фиброз и/или недостаточность костного мозга, связанная с теломерами, врожденный дискератоз | AD | 42 | 73 |
TERT | Апластическая анемия, легочный фиброз и/или недостаточность костного мозга, связанная с теломерами, врожденный дискератоз | AD/AR | 48 | 156 |
TINF2 | Синдром Ревеса, врожденный дискератоз | AD | 25 | 42 |
TMEM127 | Феохромоцитома | AD | 30 | 52 |
TP53 | Колоректальный рак, синдром Ли-Фраумени, эпендимома, внутричерепная, папиллома сосудистого сплетения, рак молочной железы, семейный, адренокортикальная карцинома, остеогенная саркома, гепатобластома, неходжкинская лимфома | AD | 393 | 505 |
TRIP13 | Синдром мозаичной пестрой анеуплоидии 3 | 2 | 2 | |
TSC1 | Лимфангиолейомиоматоз, Туберозный склероз | AD | 177 | 372 |
TSC2 | Лимфангиолейомиоматоз, Туберозный склероз | AD | 396 | 1195 |
VHL | Эритроцитоз, семейный, феохромоцитома, болезнь Гиппеля-Линдау | AD/AR | 206 | 614 |
WRN | синдром Вернера | AR | 64 | 107 |
WT1 | Синдром Дени-Драша, синдром Фрейзера, опухоль Вильмса, нефротический синдром, тип 4 | AD | 42 | 183 |
XPA | пигментная ксеродерма | AR | 49 | 47 |
XPC | пигментная ксеродерма | AR | 67 | 91 |
XRCC2 | Наследственный рак молочной железы | AD/AR | 10 | 21 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.