Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Нефротический синдром входит 96 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций. Кроме того, она также включает наследуемый по материнской линии митохондриальный геном.
Идеально подходит для пациентов с нефротическим синдромом.
Нефротический синдром обусловлен нарушением барьера клубочковой фильтрации, что приводит к обширной протеинурии, гипоальбуминемии, гиперлипидемии и отекам. Большинство пациентов (80-90%) с нефротическим синдромом реагируют на лечение стероидами и достигают ремиссии с хорошим долгосрочным прогнозом. Остальные 10–20% считаются больными стероидорезистентным нефротическим синдромом. Некоторые из этих пациентов могут реагировать на другие иммуносупрессивные методы лечения. Прогноз стероидрезистентного нефротического синдрома плохой, поскольку у 30–40% развивается терминальная стадия почечной недостаточности, требующая диализа и трансплантации (PMID: 19280229). Десятилетия обширных исследований позволили получить важную информацию о молекулярно-генетической структуре и функции барьера клубочковой фильтрации. Идентификация в гене нефрина (NPHS1) мутации, вызывающей врожденный нефроз финского типа, открыла новую эру в понимании патофизиологии и генетики протеинурических заболеваний. Идентифицированные гены, их мутации и корреляции генотип-фенотип в настоящее время внедряются в повседневную клиническую практику посредством генетического тестирования. Неэффективного лечения стероидами и другими иммунодепрессантами можно избежать с помощью генетического тестирования у пациентов с нефротическим синдромом (PMID: 20798252). Идентификация причинных мутаций также может быть использована для прогнозирования повышенного риска посттрансплантационной протеинурии. Частота рецидивов после трансплантации обычно высока, но почти неизвестна у пациентов с генетическим происхождением заболевания. После установления генетического диагноза трансплантация, особенно родственная трансплантация, может быть изучена в качестве терапевтического варианта на ранних стадиях заболевания (PMID: 20798252). Панель Нефротический синдром также включает заболевания, приводящие к прогрессирующей почечной недостаточности, такие как синдром Альпорта.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACTN4 | Фокальный сегментарный гломерулосклероз | AD | 4 | 31 |
ADCK4 | Нефротический синдром | AR | 11 | 27 |
ANLN | Фокальный сегментарный гломерулосклероз | AD | 2 | 4 |
APOL1 | Спорадический идиопатический стероидрезистентный нефротический синдром с фокальным сегментарным гиалинозом | AD/AR | 1 | |
ARHGAP24 | Семейный идиопатический стероидрезистентный нефротический синдром с фокальным сегментарным гиалинозом | AD/AR | 3 | 10 |
ARHGDIA | Нефротический синдром | AR | 3 | 3 |
CD2AP | Гломерулосклероз, фокально-сегментарный | AR | 3 | 14 |
COL4A3 | Синдром Альпорта, гематурия, доброкачественная семейная форма. | AD/AR | 123 | 264 |
COL4A4 | синдром Альпорта | AD/AR | 110 | 232 |
COL4A5 | синдром Альпорта | XL | 704 | 992 |
COQ2 | Дефицит коэнзима Q10 | AR | 16 | 31 |
COQ6 | Дефицит коэнзима Q10 | AR | 14 | 15 |
CRB2 | Фокальный сегментарный гломерулосклероз, вентрикуломегалия при кистозной болезни почек | AR | 12 | 22 |
CUBN | Мегалобластная анемия-1, финская | AR | 42 | 53 |
DGKE | Нефротический синдром | AR | 17 | 38 |
DLC1 | Нефротический синдром | AR | 5 | 22 |
EMP2 | Нефротический синдром | AR | 3 | 3 |
FAN1 | Интерстициальный нефрит, кариомегалический | AR | 12 | 21 |
FAT1 | Нефротический синдром | AR | 2 | 36 |
FN1 | Гломерулопатия с отложениями фибронектина 2 | AD | 14 | 25 |
INF2 | Гломерулосклероз, болезнь Шарко-Мари-Тута. | AD | 20 | 67 |
ITGA3 | Интерстициальное заболевание легких с нефротическим синдромом и буллезным эпидермолизом | AR | 6 | 11 |
KANK1 | ДЦП, спастический паралич, 2, Нефротический синдром | AD | 4 | 10 |
KANK2 | Ладонно-подошвенная кератодермия и курчавые волосы, нефротический синдром. | AR | 3 | 3 |
KANK4 | Нефротический синдром | AR | 1 | |
LAGE3 | 3 | 3 | ||
LAMB2 | Нефротический синдром, синдром Пирсона | AR | 20 | 122 |
LMX1B | Синдром ногтя-надколенника | AD | 26 | 194 |
LYZ | Амилоидоз системный неневропатический | AD | 5 | 10 |
MAFB | Мультицентрический карпотарзальный остеолиз | AD | 13 | 23 |
MAGI2 | Нефротический синдром 15 | AR | 7 | 27 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера, атаксия и полинейропатия, начало у взрослых, кардиомиопатия, детская гипертрофическая, синдром Лея, стриатонигральная дегенерация, детская, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофия и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофия | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с-оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, наследственная нейропатия зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия зрительного нерва Лебера и дистония | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и эпизоды, подобные инсульту. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Синдром диабетической глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, Нефропатия, тубулоинтерстициальная, Энцефалопатия, митохондриальная, Эпилепсия, митохондриальная, Миопатия, митохондриальная, Митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, синдром диабетической глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС, восприимчивость к | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами. | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | синдром Лея, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая внешняя офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание. | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальной миопатией, энцефалопатией, лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами. | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | синдром Лея, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 4 | |
MYH9 | Синдром Себастьяна, аномалия Мэй-Хегглина, синдром Эпштейна, синдром Фехтнера, макротромбоцитопения и прогрессирующая нейросенсорная глухота, глухота, аутосомно-доминантный тип 17 | AD | 25 | 117 |
MYO1E | Фокальный сегментарный гломерулосклероз | AR | 3 | 22 |
NPHS1 | Нефротический синдром | AR | 171 | 318 |
NPHS2 | Нефротический синдром | AR | 54 | 208 |
NUP107 | Нефротический синдром, тип 11 | AR | 6 | 12 |
NUP133 | AR | 1 | 2 | |
NUP205 | Нефротический синдром, тип 13 | 1 | 2 | |
NUP85 | 1 | |||
NUP93 | Нефротический синдром | 5 | 9 | |
OSGEP | Синдром Галлоуэя-Мовата | AR | 11 | 17 |
PAX2 | Изолированная гипоплазия почек, Папиллоренальный синдром, Фокально-сегментарный гломерулосклероз 7 | AD | 30 | 96 |
PDSS2 | Дефицит коэнзима Q10 | AR | 8 | 4 |
PLCE1 | Нефротический синдром | AR | 13 | 62 |
PTPRO | Нефротический синдром | AR | 3 | 10 |
SCARB2 | Эпилепсия, прогрессирующая миоклония | AR | 23 | 27 |
SGPL1 | Нефротический синдром 14 | AR | 8 | 17 |
SMARCAL1 | Иммунооссальная дисплазия Шимке | AR | 20 | 88 |
TBC1D8B | 1 | |||
TP53RK | 4 | 5 | ||
TPRKB | 2 | 2 | ||
TRIM8 | Эпилептическая энцефалопатия | AD | 1 | 2 |
TRPC6 | Фокальный сегментарный гломерулосклероз | AD | 13 | 45 |
TTC21B | Короткореберная дисплазия грудной клетки, нефронофтиз, удушающая торакальная дисплазия (ATD; Jeune) | AR | 23 | 63 |
TTR | Дистранстиретинемическая гипертироксинемия, Амилоидоз, наследственный, транстиретин-связанный | AD | 52 | 148 |
WDR4 | AR | 1 | 6 | |
WDR73 | Синдром Галлоуэя-Мовата | AR | 9 | 12 |
WT1 | Синдром Дениса-Драша, синдром Фрейзера, опухоль Вильмса, нефротический синдром, тип 4 | AD | 42 | 183 |
XPO5 | Нефротический синдром | 3 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.