Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Несовершенный остеогенез входит 33 гена, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций. Гены этой панели входят в Расширенную панель нарушений скелета.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на Несовершенный остеогенез или родственное заболевания.
Фенотип несовершенного остеогенеза варьирует от остеопороза, проявляющегося во взрослом возрасте, до летальности в младенчестве. На две самые легкие формы, классический недеформирующий несовершенный остеогенез и распространенный вариабельный несовершенный остеогенез, приходится значительно более половины всех случаев болезни. Около 90% пациентов имеют мутации в генах коллагена I типа (COL1A1 и COL1A2). Несовершенный остеогенез, связанный с COL1A1/2, наследуется по аутосомно-доминантному типу. Недавно было идентифицировано несколько дополнительных генов. Первичным дифференциальным диагнозом для лиц с признаками несовершенного остеогенеза, связанного с COL1A1/2, являются аутосомно-рецессивные подтипы несовершенного остеогенеза. Доля случаев, вызванных мутацией de novo COL1A1 или COL1A2, зависит от тяжести заболевания: примерно 60% случаев классического недеформирующего несовершенного остеогенеза с голубыми склерами или обычного вариабельного несовершенного остеогенеза с нормальными склерами, практически 100% случаев перинатально летального несовершенного остеогенеза, и почти 100% прогрессивно деформирующихся несовершенного остеогенеза возникают de novo. Гонадный мозаицизм может присутствовать в 3-5% случаев. Распространенность заболевания составляет примерно 6-7:100 000. Основным клиническим проявлением является хрупкость скелета. Могут присутствовать деформация скелета, низкий рост, сколиоз и червячные кости. Другие внескелетные проявления могут включать потерю слуха, несовершенный дентиногенез, голубые/серые склеры, гиперкальциурию, легкую кровоточивость, повышенную дряблость связок, кожные и сердечно-сосудистые аномалии. Дифференциальный диагноз включает рахит, остеомаляцию и другие редкие скелетные синдромы. Мы включили гены гипофосфатазии на эту панель в дифференциально-диагностических целях. Мы также включили гены для некоторых синдромов/расстройств, при которых остеопения/переломы являются одним из результатов дифференциальной диагностики в случаях с ограниченной клинической информацией, например, у новорожденных.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ALPL | Одонтогипофосфатазия, гипофосфатазия перинатальная летальная, инфантильная, ювенильная и взрослая формы | AD/AR | 78 | 291 |
ARCN1 | Ризомелическая низкорослость с микроцефалией, микрогнатией и задержкой развития (SRMMD) | AD | 3 | 3 |
B3GAT3 | Множественные вывихи суставов, низкий рост, черепно-лицевой дисморфизм и врожденные пороки сердца | AR | 6 | 13 |
B4GALT7 | Синдром Элерса-Данлоса, прогероидная форма | AR | 8 | 9 |
BMP1 | Несовершенный остеогенез | AR | 7 | 21 |
CLCN5 | Протеинурия, низкомолекулярная, с гиперкальциурическим нефрокальцинозом, Гипофосфатемический рахит, Нефролитиаз, I, Болезнь Дента | XL | 48 | 272 |
COL1A1 | Синдром Элерса-Данлоса, болезнь Каффи, несовершенный остеогенез 1 типа, несовершенный остеогенез 2 типа, несовершенный остеогенез 3 типа, несовершенный остеогенез 4 типа | AD | 352 | 962 |
COL1A2 | Синдром Элерса-Данлоса, клапанная форма сердца, несовершенный остеогенез 1 типа, несовершенный остеогенез 2 типа, несовершенный остеогенез 3 типа, несовершенный остеогенез 4 типа | AD/AR | 186 | 509 |
CREB3L1 | Несовершенный остеогенез, тип XVI | AR | 2 | 3 |
CRTAP | Несовершенный остеогенез 2 типа, Несовершенный остеогенез 3 типа, Несовершенный остеогенез 4 типа | AR | 12 | 30 |
FAM46A | Несовершенный остеогенез | AR | 3 | 3 |
FGF23 | Опухолевой кальциноз, гиперфосфатемический, гипофосфатемический рахит | AD/AR | 10 | 17 |
FKBP10 | Синдром Брука 1, несовершенный остеогенез, тип XI | AR | 20 | 44 |
IFITM5 | Несовершенный остеогенез 5 типа | AD | 2 | 2 |
LRP5 | Болезнь Ван Бюхема, синдром остеопороза-псевдоглиомы, гиперостоз, эндостальный, остеосклероз, экссудативная витреоретинопатия, поздняя форма остеопетроза 1 типа, первичный остеопороз LRP5 | AD/AR/Digenic | 57 | 196 |
MBTPS2 | Декальвирующий фолликулярный шиповидный кератоз, синдром IFAP, ладонно-подошвенная кератодермия, калечащая, с периорифициальными кератотическими бляшками | XL | 12 | 25 |
P3H1 | Несовершенный остеогенез | AR | 18 | 63 |
P4HB | Синдром Коула Карпентера 1 | AD | 1 | 11 |
PHEX | Гипофосфатемический рахит | XL | 263 | 437 |
PLOD2 | Синдром Брука, несовершенный остеогенез 3 типа | AR | 8 | 23 |
PLS3 | Остеопороз и остеопоротические переломы | XL | 1 | 17 |
PPIB | Несовершенный остеогенез 2 типа, Несовершенный остеогенез 3 типа, Несовершенный остеогенез 4 типа | AR | 8 | 13 |
SEC24D | Синдром Коула-Карпентера 2 | AR | 4 | 12 |
SERPINF1 | Несовершенный остеогенез, тип VI | AR | 9 | 41 |
SERPINH1 | Несовершенный остеогенез 3 типа | AR | 3 | 6 |
SGMS2 | Остеопороз и остеопорозные переломы, Скелетная дисплазия и нарушения | AD | ||
SLC29A3 | Гистиоцитоз-лимфаденопатия плюс синдром, Дизостеосклероз | AR | 17 | 25 |
SLC34A3 | Гипофосфатемический рахит с гиперкальциурией | AR | 22 | 38 |
SP7 | Несовершенный остеогенез XII типа. | AR | 2 | 3 |
SPARC | Кератоконус, несовершенный остеогенез, XVII тип | AR | 2 | 4 |
TAPT1 | 2 | 3 | ||
TMEM38B | Несовершенный остеогенез, тип XIV | AR | 2 | 7 |
WNT1 | Остеопрос, аутосомно-доминантный, несовершенный остеогенез, тип XV | AD/AR | 9 | 40 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.