Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Нейропатия Шарко-Мари-Тута входит 153 генов, включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций (ХМА).
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на Нейропатию Шарко-Мари-Тута.
Невропатия Шарко-Мари-Тута , также известная как наследственная моторная/сенсорная невропатия (HMSN), является наиболее распространенной генетической причиной невропатии. Распространенность оценивается как 1:3300. ШМТ характеризуется широкой генетической гетерогенностью и может наследоваться по аутосомно-доминантному, аутосомно-рецессивному или Х-сцепленному типу. Невропатия Шарко-Мари-Тута возникает в результате поражения периферических нервов, которые могут влиять на двигательную систему и/или сенсорную систему. Лица с Невропатией Шарко-Мари-Тута испытывают симметричную, медленно прогрессирующую дистальную моторную невропатию рук и ног, обычно начинающуюся в первом-третьем десятилетии жизни и приводящую к слабости и атрофии мышц стоп и/или рук. Часто встречается деформация стопы Pes Cavus. Нейропатии ШМТ можно разделить на демиелинизирующие и аксональные формы.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AARS | Эпилептическая энцефалопатия, ранняя инфантильная, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 9 | 16 |
AGTPBP1 | невропатия | AR | 3 | 1 |
AIFM1 | Глухота, комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования 6, синдром Коучока | XL | 27 | 31 |
AMACR | Дефицит альфа-метилацил-КоА-рацемазы, дефект синтеза желчных кислот | AR | 3 | 8 |
ARHGEF10 | Замедленная скорость нервной проводимости | AD | 4 | 12 |
ATAD3A | Синдром Харела-Юна | AD/AR | 4 | 17 |
ATL1 | Спастическая параплегия, нейропатия, наследственная сенсорная | AD | 29 | 84 |
ATL3 | нейропатия, наследственная сенсорная | AD | 1 | 4 |
ATP1A1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 8 | 10 |
ATP7A | Болезнь Менкеса, синдром затылочного рога, спинальная мышечная атрофия, дистальная, Х-сцепленная 3 | XL | 116 | 354 |
BAG3 | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), миопатия, миофибриллярная | AD | 39 | 62 |
BICD2 | Детская проксимальная спинальная мышечная атрофия с контрактурами | AD | 12 | 28 |
BSCL2 | Липодистрофия, врожденная генерализованная, Энцефалопатия, прогрессирующая, Нейропатия, дистальная наследственная моторная, тип VA, Болезнь Шарко-Мари-Тута 2 тип, Синдром Сильвера, Синдром спастической параплегии Сильвера, Спастическая параплегия 17 | AD/AR | 34 | 50 |
C12ORF65 | Спастическая параплегия, дефицит комбинированного окислительного фосфорилирования | AR | 10 | 11 |
CCT5 | Нейропатия, наследственная сенсорная, со спастической параплегией | AR | 1 | 1 |
CHCHD10 | Миопатия, изолированная митохондриальная, лобно-височная деменция и/или боковой амиотрофический склероз 2, спинальная мышечная атрофия, тип Джокела | AD | 4 | 26 |
COA7 | Спиноцеребеллярная атаксия, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 2 | 7 |
COX10 | Синдром Лея, дефицит митохондриального комплекса IV | AR | 52 | 13 |
COX6A1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 2 | 1 |
CTDP1 | Врожденная катаракта, лицевой дисморфизм и невропатия | AR | 1 | 1 |
CYP27A1 | Церебротендинозный ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
DCAF8 | Гигантская аксональная невропатия 2, аутосомно-доминантная | AD | 1 | 1 |
DCTN1 | Синдром Перри, невропатия, дистальный наследственный моторный | AD | 10 | 52 |
DHTKD1 | 2-аминоадипиновая и 2-оксоадипиновая ацидурия, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 11 | 18 |
DNAJB2 | Спинальная мышечная атрофия, дистальная, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 9 | 5 |
DNM2 | Миопатия, летальная акинезия и скелетно-мышечные аномалии с кровоизлияниями в мозг и сетчатку, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 28 | 47 |
DNMT1 | Невропатия, наследственная сенсорная, мозжечковая атаксия, глухота и нарколепсия | AD | 9 | 20 |
DST | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная | AR | 13 | 7 |
DYNC1H1 | Спинальная мышечная атрофия, болезнь Шарко-Мари-Тута, умственная отсталость | AD | 60 | 71 |
EGR2 | Невропатия, болезнь Дежерина-Сотта, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 13 | 21 |
FAM134B | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная | AR | 8 | 5 |
FBLN5 | Cutis laxa, дегенерация желтого пятна, возрастная | AD/AR | 13 | 22 |
FBXO38 | Нейронопатия, дистальная наследственная двигательная | AD | 1 | 5 |
FGD4 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 21 | 27 |
FIG4 | Боковой амиотрофический склероз, полимикрогирия, двусторонняя затылочная, синдром Юниса-Варона, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 34 | 69 |
FXN | атаксия Фридрейха | AR | 13 | 63 |
GAN | Гигантская аксональная невропатия | AR | 18 | 76 |
GARS | Нейропатия, дистальная наследственная моторика, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 19 | 38 |
GDAP1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 39 | 100 |
GJB1 | невропатия Шарко-Мари-Тута | XL | 98 | 495 |
GNB4 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 2 | 5 |
GNE | Проксимальная миопатия и офтальмоплегия, миопатия Нонака, сиалурия | AD/AR | 78 | 214 |
GSN | Амилоидоз финского типа | AD | 3 | 13 |
HADHB | Дефицит трифункционального белка | AR | 20 | 65 |
HARS | Болезнь Шарко-Мари-Тута, аксональная, тип 2W, синдром Ушера, тип 3B | AD/AR | 6 | 12 |
HINT1 | Аксональная невропатия с нейромиотонией | AR | 11 | 15 |
HK1 | Гемолитическая анемия, несфероцитарная, обусловленная дефицитом гексокиназы, пигментный ретинит 79, нейропатия моторная и сенсорная, тип Russe (болезнь Шарко-Мари-Тута тип 4G) | AD/AR | 9 | 7 |
HSPB1 | Нейропатия, дистальная наследственная моторика, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 27 | 44 |
HSPB8 | Болезнь Шарко-Мари-Тута, дистальная наследственная моторная нейронопатия | AD | 6 | 9 |
IGHMBP2 | Спинальная мышечная атрофия, дистальная, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 52 | 128 |
IKBKAP | Дизавтономия, семейная, наследственная сенсорная и вегетативная невропатия | AR | 47 | 6 |
INF2 | Гломерулосклероз, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 20 | 67 |
KARS | Болезнь Шарко-Мари-Тута, глухота, аутосомно-рецессивный | AR | 9 | 23 |
KIF1A | Спастическая параплегия, нейропатия, наследственная сенсорная, умственная отсталость | AD/AR | 63 | 42 |
KIF1B | Феохромоцитома, нейробластома, болезнь Шарко-Мари-Тута, тип 2А1 | AD | 7 | 12 |
KIF5A | Спастическая параплегия | AD | 18 | 62 |
LDB3 | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), миопатия, миофибриллярная | AD | 9 | 14 |
LITAF | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 10 | 18 |
LMNA | Синдром сердце-рука, словенский, поясно-конечностная мышечная дистрофия, мышечная дистрофия, врожденная, связанная с LMNA, липодистрофия (Данниган), мышечная дистрофия Эмери-Дрейффуса, синдром Малуфа, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), мандибулоакральная дисплазия типа А, прогерия Хатчинсона- Гилфорд тип | AD/AR | 250 | 564 |
LRSAM1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 15 | 14 |
MARS | Интерстициальное заболевание легких и печени, болезнь Шарко-Мари-Тута, болезнь Шарко-Мари-Тута, аксональный тип 2U | AD/AR | 9 | 13 |
MCM3AP | невропатия Шарко-Мари-Тута | AR | 8 | 19 |
MED25 | Синдром Базеля-Ванагайта-Смирина-Йосефа, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 4 | 5 |
MFN2 | Наследственная моторная и сенсорная невропатия, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 70 | 223 |
MME | Спиноцеребеллярная атаксия 43, болезнь Шарко-Мари-Тута, аксональная, тип 2Т | AD/AR | 14 | 21 |
MORC2 | Тип болезни Шарко-Мари-Тута, аксональный, тип 2Z | AD | 6 | 17 |
MPV17 | Синдром истощения митохондриальной ДНК | AR | 35 | 50 |
MPZ | Невропатия, синдром Русси-Леви, болезнь Дежерина-Сотта, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 108 | 241 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная оптическая невропатия Лебера, атаксия и полинейропатия, с началом во взрослом возрасте, кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая, синдром Ли, стриатонигральная дегенерация, инфантильная, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофическая и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная оптическая нейропатия Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром с оксидазы, наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Диабет-синдром глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, нефропатия, тубулоинтерстициальная, энцефалопатия, митохондриальная, эпилепсия, митохондриальная, миопатия, митохондриальная, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, диабет-синдром глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС, восприимчивость к | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Ли, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 4 | |
MTMR2 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 13 | 23 |
MYOT | Миопатия, миофибриллярная, Мышечная дистрофия, поясно-конечностная, 1А, Миопатия, сфероидное тело | AD | 6 | 16 |
NDRG1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 6 | 8 |
NEFH | Болезнь Шарко-Мари-Тута, аксональная, тип 2СС | AD/AR | 4 | 21 |
NEFL | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 24 | 40 |
NGF | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная | AR | 2 | 6 |
NTRK1 | Нечувствительность к боли, врожденная, с ангидрозом, Медуллярная карцинома щитовидной железы, семейная | AR | 38 | 123 |
PDK3 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | XL | 1 | 3 |
PLEKHG5 | Спинальная мышечная атрофия, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 16 | 8 |
PMP2 | 1 | 3 | ||
PMP22 | Нейропатия, воспалительная демиелинизирующая, синдром Русси-Леви, болезнь Дежерина-Сотта, невропатия наследственная, со склонностью к параличам давления, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 49 | 165 |
PNKP | Эпилептическая энцефалопатия, ранняя инфантильная, атаксия-глазодвигательная | AR | 34 | 23 |
POLG | Расстройства спектра нейропатии атаксии, связанной с POLG, сенсорная атаксия, дизартрия и офтальмопарез, синдром Альперса, прогрессирующая наружная офтальмоплегия с недостаточностью митохондриальной ДНК, синдром истощения митохондриальной ДНК | AD/AR | 89 | 290 |
POLG2 | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия с недостаточностью митохондриальной ДНК | AD | 5 | 14 |
PRDM12 | Невропатия, наследственная сенсорно-вегетативная, VIII тип | AR | 7 | 11 |
PRPS1 | Сверхактивность фосфорибозилпирофосфатсинтетазы I, синдром Артса, болезнь Шарко-Мари-Тута, Х-сцепленный рецессивный, 5, Глухота, Х-сцепленный 1 | XL | 27 | 32 |
PRX | Болезнь Дежерина-Сотта, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 26 | 55 |
RAB7A | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 5 | 7 |
REEP1 | Спастическая параплегия, Дистальная наследственная моторная нейронопатия | AD | 16 | 60 |
SACS | Спастическая атаксия Шарлевуа-Сагенэ | AR | 254 | 262 |
SBF1 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 5 | 10 |
SBF2 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 25 | 21 |
SCN11A | Эпизодический болевой синдром, семейный, 3, Невропатия, наследственная сенсорно-вегетативная, VII тип | AD | 8 | 20 |
SCN9A | Пароксизмальное сильное болевое расстройство, невропатия мелких волокон, эритермалгия, первичная, генерализованная эпилепсия с фебрильными судорогами плюс, тип 7, нечувствительность к боли, врожденная, аутосомно-рецессивная | AD/AR | 61 | 125 |
SCYL1 | Спиноцеребеллярная атаксия, аутосомно-рецессивная 21 | AR | 12 | 6 |
SEPT9 | Амиотрофия, наследственная невралгия | AD | 4 | 11 |
SETX | Атаксия с глазодвигательной апраксией, Боковой амиотрофический склероз, Ювенильная, Спиноцеребеллярная атаксия | AD/AR | 36 | 210 |
SH3TC2 | Мононевропатия срединного нерва, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 63 | 89 |
SLC12A6 | Агенезия мозолистого тела с периферической невропатией (синдром Андермана) | AD/AR | 43 | 19 |
SLC25A46 | Нейропатия, наследственная моторно-сенсорная, тип VIB | AR | 14 | 17 |
SLC52A2 | Синдром Брауна-Виалетто-Ван Лаэра | AR | 27 | 25 |
SLC52A3 | Болезнь Фацио-Лонде, синдром Брауна-Виалетто-Ван Лаэра | AR | 30 | 42 |
SMAD3 | Синдром аневризмы-остеоартрита, синдром Лойса-Дитца | AD | 48 | 82 |
SPG11 | Спастическая параплегия, Боковой амиотрофический склероз, Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 162 | 274 |
SPTBN4 | Миопатия врожденная с невропатией и глухотой | AR | 6 | 7 |
SPTLC1 | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная | AD | 8 | 11 |
SPTLC2 | Наследственная сенсорная и вегетативная невропатия | AD | 5 | 14 |
SURF1 | Синдром Лея, болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 50 | 101 |
TFG | Спастическая параплегия, Наследственная моторная и сенсорная невропатия, проксимальная | AR | 4 | 7 |
TRIM2 | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AR | 5 | 8 |
TRPV4 | Метатропная дисплазия, Спондилоэпифизарная дисплазия типа Маро, Парастремматическая карликовость, Наследственная моторная и сенсорная невропатия, Спондилометафизарная дисплазия типа Козловского, Спинальная мышечная атрофия, Болезнь Шарко-Мари-Тута, Брахиолмия (аутосомно-доминантный тип), Семейная пальцевая артропатия с брахидактилией | AD | 61 | 78 |
TTR | Дистранстиретинемическая гипертироксинемия, амилоидоз, наследственный, связанный с транстиретином | AD | 52 | 148 |
TYMP | Синдром истощения митохондриальной ДНК | AR | 84 | 94 |
UBA1 | Спинальная мышечная атрофия, инфантильная | XL | 3 | 5 |
VCP | Боковой амиотрофический склероз, миопатия с тельцами включения с ранним началом болезни Педжета, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 17 | 61 |
WNK1 | Невропатия, наследственная сенсорная и вегетативная, псевдогипоальдостеронизм | AD/AR | 14 | 9 |
YARS | Болезнь Шарко-Мари-Тута | AD | 6 | 11 |
ZFYVE26 | Спастическая параплегия 15 | AR | 63 | 39 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.