Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Представляет собой панель из 13 генов, которая включает оценку некодирующих вариантов. Идеально подходит для пациентов с подозрением на аутосомно-доминантный или аутосомно-рецессивный поликистоз почек.
Поликистоз почек (PKD) наследуется по аутосомно-доминантному (ADPKD) или рецессивному (ARPKD) типу. Он характеризуется наличием множественных кист, преимущественно в почках и печени, и может проявляться как в неонатальном периоде, так и во взрослом возрасте. Как правило, ADPKD диагностируется во втором и третьем десятилетиях жизни, в то время как ARPKD часто проявляется внутриутробно или в неонатальном периоде двусторонним увеличением почек. Большинство семей с ADPKD имеют дефекты в гене PKD1 (85%) и меньшую долю в гене PKD2 (15%). Антенатальное УЗИ может показать увеличенные гиперэхогенные почки или макрокисты. Инфекция кисты почки представляет сложную проблему и требует агрессивной антибактериальной терапии. ARPKD часто ассоциируется с поражением печени. Гистологически ARPKD имеет характерный радиальный рисунок веретенообразных кист, присутствующих в расширенных собирательных трубочках. Терминальная стадия почечной недостаточности с дебютом в детском возрасте (ESRD) характерна для ARPKD, при этом до 30% случаев требуют трансплантации почки. Однако ESRD редко возникает в возрасте до 15 лет.
ADPKD является наиболее распространенной формой поликистозной болезни почек, распространенность которой оценивается в 1: 400–1: 1000, поэтому это заболевание не является редким. ARPKD встречается редко, распространенность в общей популяции составляет 1:85 000.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
DNAJB11 | Аутосомно-доминантный поликистоз почек | AD | 6 | 1 |
DZIP1L | Поликистоз почек 5 | AR | 4 | 5 |
GANAB | Поликистоз почек и/или поликистоз печени 3 | AD | 7 | 12 |
HNF1B | Почечно-клеточный рак, непапиллярный хромофоб, почечные кисты и диабетический синдром | AD | 35 | 234 |
JAG1 | Синдром Алажиля | AD | 131 | 610 |
LRP5 | Болезнь Ван Бюхема, синдром остеопороза-псевдоглиомы, гиперостоз, эндостальный, остеосклероз, экссудативная витреоретинопатия, поздняя форма остеопетроза 1 типа, первичный остеопороз LRP5 | AD/AR/Digenic | 57 | 196 |
NOTCH2 | синдром Алажиля, синдром Хайду-Чейни | AD | 37 | 70 |
PKD1 | Поликистоз почек | AD | 237 | 1923 |
PKD2 | Поликистоз почек | AD | 55 | 333 |
PKHD1 | Поликистоз почек | AR | 249 | 557 |
PRKCSH | Поликистоз печени | AD | 9 | 28 |
SEC61A1 | Гиперурикемическая нефропатия, семейная ювенильная 4 | AD | 4 | 4 |
SEC63 | Поликистоз печени | AD | 8 | 23 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.