Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Панель из 100 генов, включающая оценку некодирующих вариантов. Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на низкий рост и связанные с ним расстройства.
Клинические фенотипы расстройств, охватываемых этой панелью, варьируются по тяжести задержки роста и микроцефалии, а также по степени задержки развития, но между синдромами может быть значительное клиническое совпадение. В дополнение к расстройствам, охватываемым небольшими панелями, эта комплексная панель охватывает несколько других заболеваний, связанных с низким ростом, таких как задержка роста из-за резистентности к инсулиноподобному фактору роста I или дефицита IGF1 (мутации в IGF1R и IGF1), гипотиреоз из-за к дефицитным транскрипционным факторам, участвующим в развитии или функционировании гипофиза (HESX1, LHX3, LHX4, POU1F1 и PROP1), синдрому Рубинштейна-Тайби (CREBBP и EP300), синдрому Корнелии де Ланге (NIPBL, RAD21, SMC3, HDAC8 и SMC1A) и различным формам непропорционально низкого роста. Непропорционально низкий рост может проявляться в виде карликовости коротких конечностей или карликовости короткого туловища. Ахондроплазия (аутосомно-доминантное заболевание, мутация FGFR3) является наиболее распространенной формой непропорциональной задержки роста, ее частота оценивается примерно в 1/25 000 живорождений во всем мире. Выявление редких моногенных причин низкого роста имеет решающее значение, поскольку генетический диагноз может предупредить врача о других сопутствующих заболеваниях, по которым пациент находится в группе риска. Например, пациента мужского пола с синдромом 3-М необходимо будет наблюдать на предмет развития гипогонадизма. На основании генетических исследований у детей с выраженной низкорослостью неясной этиологии высказано предположение, что моногенные причины низкорослости недостаточно диагностируются в детской эндокринной клинике. Факторами, повышающими вероятность моногенной причины низкорослости, являются тяжелый дефицит гормона роста, множественный дефицит гормонов гипофиза, явная нечувствительность к гормону роста, малый размер для гестационного возраста без отставания в росте, дополнительные врожденные аномалии или дисморфические особенности, связанная с этим умственная отсталость, микроцефалия и рост. ниже −3SD (стандартных отклонения).
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACTB | Синдром Барайцера-Винтера | AD | 55 | 60 |
ACTG1 | Глухота, синдром Барайцера-Винтера. | AD | 27 | 47 |
AMMECR1 | Гипоплазия средней зоны лица, нарушение слуха, эллиптоцитоз и нефрокальциноз. | XL | 4 | 5 |
ARCN1 | Ризомелический низкорослость с микроцефалией, микрогнатией и задержкой развития (SRMMD) | AD | 3 | 3 |
ATR | Кожная телеангиэктазия и раковый синдром, синдром Секкеля | AD/AR | 10 | 33 |
B3GAT3 | Множественные вывихи суставов, низкий рост, черепно-лицевой дисморфизм и врожденные пороки сердца | AR | 6 | 13 |
BCS1L | Синдром Бьёрнстада, синдром GRACILE, синдром Ли, дефицит митохондриального комплекса III, ядерный тип 1 | AR | 42 | 37 |
BLM | Синдром Блума | AR | 152 | 119 |
BMP2 | Брахидактилия типа А2 | AD | 5 | 28 |
BRAF | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, кардиофациально-кожный синдром | AD | 134 | 65 |
CBL | Расстройство, подобное синдрому Нунан, с ювенильным миеломоноцитарным лейкозом или без него | AD | 24 | 43 |
CCDC8 | Синдром трех М 3 | AR | 2 | 3 |
CDC45 | Синдром Мейера-Горлина 7 | AR | 10 | 19 |
CDC6 | Синдром Мейера-Горлина (синдром уха-надколенника-низкого роста) | AR | 2 | 2 |
CDT1 | Синдром Мейера-Горлина (синдром уха-надколенника-низкого роста) | AR | 6 | 12 |
CENPJ | синдром Секкеля, микроцефалия | AR | 34 | 9 |
CEP152 | синдром Секкеля, микроцефалия | AR | 20 | 20 |
CEP63 | синдром Секкеля | AR | 7 | 2 |
COL27A1 | Стальной синдром | AR | 7 | 7 |
CREBBP | Синдром Рубинштейна-Тайби | AD | 175 | 362 |
CUL7 | Синдром 3-М, синдром якутского низкорослости | AR | 26 | 83 |
DHCR7 | Синдром Смита-Лемли-Опитца | AR | 88 | 217 |
DONSON | Микроцефалия, низкий рост и аномалии конечностей (MISSLA), синдром микроцефалии-микромелии | AR | 10 | 19 |
EP300 | Синдром Рубинштейна-Тайби | AD | 63 | 101 |
FGD1 | Синдром Аарскога-Скотта, Умственная отсталость, синдромальный | XL | 29 | 51 |
FGFR3 | Лакримоаурикулодентодигитальный синдром, синдром Мюнке, синдром Крузона с черным акантозом, синдром камптодактилии, высокого роста и потери слуха (CATSHL), ахондроплазия, гипохондроплазия, танатофорная дисплазия 1 типа, танатофорная дисплазия 2 типа, САДДАН | AD/AR | 54 | 77 |
FN1 | Гломерулопатия с отложениями фибронектина 2 | AD | 14 | 25 |
GH1 | Изолированный дефицит гормона роста, синдром Коварского | AD/AR | 25 | 90 |
GHR | Синдром нечувствительности к гормону роста (синдром Ларона) | AD/AR | 35 | 115 |
GHRHR | Изолированный дефицит гормона роста | AR | 13 | 51 |
GHSR | Невысокий рост | AD/AR | 2 | 12 |
GLI2 | Синдром Каллера-Джонса | AD | 29 | 82 |
GNAS | Синдром МакКьюна-Олбрайта, Прогрессирующая костная гетероплазия, Псевдогипопаратиреоз, Наследственная остеодистрофия Олбрайта | AD | 64 | 274 |
HDAC8 | Синдром Корнелии де Ланге | XL | 41 | 50 |
HESX1 | Септооптическая дисплазия, Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный, Изолированный дефицит гормона роста | AR/AD | 15 | 26 |
HRAS | Синдром Костелло, врожденная миопатия с избытком мышечных веретен. | AD | 43 | 31 |
IDUA | Мукополисахаридоз | AR | 105 | 282 |
IGF1 | Дефицит инсулиноподобного фактора роста I | AD/AR | 4 | 8 |
IGF1R | Инсулиноподобный фактор роста I, резистентность | AD/AR | 12 | 64 |
IGFALS | Белок, связывающий инсулиноподобный фактор роста, кислотолабильная субъединица, дефицит | AR | 5 | 34 |
INSR | Гиперинсулинемическая гипогликемия, семейная, синдром Рабсона-Менденхолла, синдром Донохо | AD/AR | 44 | 190 |
IRS1 | Сахарный диабет инсулиннезависимый | AD/AR | 3 | 17 |
KRAS | Синдром Нунан, Кардиофацио-кожный синдром | AD | 63 | 35 |
LARP7 | синдром Алазами | AR | 19 | 10 |
LFNG | Спондилокостальный дизостоз, аутосомно-рецессивный тип 3 | AR | 1 | 5 |
LHX3 | Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный | AR | 9 | 16 |
LHX4 | Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный | AD | 10 | 23 |
LZTR1 | Шванноматоз, синдром Нунан | AD/AR | 34 | 71 |
MAP2K1 | Кардиофацио-кожный синдром | AD | 45 | 23 |
MAP2K2 | Кардиофацио-кожный синдром | AD | 21 | 35 |
NIPBL | Синдром Корнелии де Ланге | AD | 311 | 425 |
NOTCH2 | Синдром Алажиля, синдром Хайду-Чейни | AD | 37 | 70 |
NRAS | Синдром Нунан | AD | 31 | 14 |
OBSL1 | синдром 3-М | AR | 13 | 33 |
ORC1 | Синдром Мейера-Горлина (синдром уха-надколенника-низкого роста) | AR | 9 | 10 |
ORC4 | Синдром Мейера-Горлина (синдром уха-надколенника-низкого роста) | AR | 24 | 6 |
ORC6 | Синдром Мейера-Горлина (синдром уха-надколенника-низкого роста) | AR | 7 | 6 |
OSGEP | Синдром Галлоуэя-Мовата | AR | 11 | 17 |
OTX2 | Микрофтальмия синдромальная, недостаточность гормонов гипофиза, комбинированная, дистрофия сетчатки, раннее начало, дисфункция гипофиза | AD | 23 | 73 |
PCNT | Микроцефальная остеодиспластическая первичная карликовость | AR | 49 | 88 |
PISD | AR | |||
PITX2 | синдром Аксенфельда-Ригера, кольцевой дермоид роговицы, иридогониодисгенез, аномалия Петерса | AD | 23 | 101 |
POC1A | Низкий рост, ониходисплазия, дисморфизм лица и гипотрихоз (синдром SOFT). | AR | 4 | 8 |
POP1 | Анауксетическая дисплазия 2 | AR | 5 | 6 |
POU1F1 | Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный | AR | 20 | 41 |
PPP3CA | Эпилептическая энцефалопатия | AD | 8 | 11 |
PRMT7 | Низкий рост, брахидактилия, нарушение умственного развития и судороги (SBIDDS) | AR | 10 | 11 |
PROP1 | Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный | AR | 33 | 37 |
PTPN11 | синдром Нунан, метахондроматоз | AD | 135 | 140 |
PUF60 | Низкий рост, микроцефалия. | AD | 24 | 30 |
RAD21 | Синдром Корнелии де Ланге 4 | AD | 14 | 11 |
RAF1 | Синдром LEOPARD, синдром Нунан, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП) | AD | 45 | 53 |
RALA | Нарушение интеллектуального развития | AD | 1 | |
RASA2 | Синдром Нунан | AD | 1 | 3 |
RBBP8 | синдром Секкеля, синдром Джавада | AR | 6 | 6 |
RIT1 | Синдром Нунан | AD | 23 | 26 |
RNU4ATAC | Синдром Ройфмана, микроцефальная остеодиспластическая примордиальная карликовость 1 типа, микроцефальная остеодиспластическая первичная карликовость 3 типа | AR | 15 | 24 |
RRAS | Нунан-синдром, подобный фенотипу | AD/AR | 2 | |
RTTN | Микроцефалия, низкий рост и полимикрогирия с судорогами или без них. | AR | 16 | 16 |
SGMS2 | Остеопороз и остеопоротические переломы, Скелетная дисплазия и нарушения | AD | ||
SHOC2 | Нунан-подобный синдром с выпадением анагенных волос. | AD | 2 | 4 |
SHOX | Дисхондростеоз Лери-Вейля, мезомелическая дисплазия Лангера, низкий рост | XL/PAR | 25 | 431 |
SMARCA2 | Синдром Николаидеса-Барайтсера | AD | 41 | 73 |
SMARCE1 | Синдром Гроба-Сириса | AD | 14 | 12 |
SMC1A | Синдром Корнелии де Ланге | XL | 73 | 87 |
SMC3 | Синдром Корнелии де Ланге | AD | 25 | 21 |
SOS1 | Синдром Нунан | AD | 44 | 71 |
SOX11 | Нарушение интеллектуального развития с микроцефалией и пороками развития глаз или без них или гипогонадотропным гипогонадизмом. | AD | 11 | 14 |
SOX2 | Микрофтальмия синдромальная | AD | 34 | 104 |
SOX3 | Пангипопитуитаризм | XL | 4 | 26 |
SRCAP | Синдром Флаат-Харбора | AD | 16 | 43 |
STAT5B | Нечувствительность к гормону роста при иммунодефиците | AD/AR | 9 | 13 |
TALDO1 | Дефицит трансальдолазы | AR | 6 | 10 |
TBX19 | Дефицит адренокортикотропного гормона | AR | 12 | 27 |
TBX2 | AD | 1 | 12 | |
TBX3 | Ульнарно-маммарный синдром | AD | 6 | 20 |
TOP3A | AR | 8 | ||
TRIM37 | Мулибрей нанизм | AR | 19 | 23 |
TRMT10A | Микроцефалия, низкий рост и нарушение метаболизма глюкозы 1 | AR | 2 | 7 |
XRCC4 | Низкий рост, микроцефалия и эндокринная дисфункция. | AR | 9 | 10 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.