Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Спастична параплегія входит 75 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на спастическую параплегию.
Спастична параплегія — це група клінічно та генетично гетерогенних нейродегенеративних розладів, що характеризуються спастичностю та слабкістю нижніх кінцівок. Якщо симптоми виникають у ранньому дитинстві, вони можуть не прогресувати і нагадувати спастичний диплегічний церебральний параліч. Якщо симптоми з’являються пізніше, вони зазвичай прогресують повільно та неухильно. Спастичну параплегію клінічно класифікують як несиндромну (неускладнену) або синдромну (ускладнену). Несиндромальні спастичні параплегії характеризуються повільно прогресуючою спастичністю та слабкістю нижніх кінцівок, часто пов’язаних із гіпертонічними порушеннями сечовипускання, легким зниженням відчуття вібрації нижніх кінцівок і, іноді, відчуття положення суглобів. Синдромні форми спастичної параплегії характеризуються наявністю додаткових неврологічних або неневрологічних ознак. Поширеність HSP оцінюється в 1-9/100 000 (GeneReviews NBK1509).
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCD1 | Адренолейкодистрофия | XL | 95 | 663 |
AFG3L2 | Спастическая атаксия, спиноцеребеллярная атаксия. | AD/AR | 22 | 40 |
ALDH18A1 | Спастическая параплегия, Cutis laxa. | AD/AR | 22 | 30 |
ALS2 | Боковой амиотрофический склероз, спастический паралич | AR | 33 | 68 |
AP4B1 | Спастическая параплегия 47, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 17 | 18 |
AP4E1 | Заикание, стойкое семейное заболевание, 1, Спастическая параплегия 51, аутосомно-рецессивный тип. | AD/AR | 7 | 15 |
AP4M1 | Спастическая параплегия 50, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 16 | 13 |
AP4S1 | Спастическая параплегия 52, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 9 | 8 |
AP5Z1 | Спастическая параплегия 48, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 11 | 14 |
ARG1 | Гипераргининемия | AR | 28 | 54 |
ARL6IP1 | Спастическая параплегия 61 | AR | 1 | 4 |
ATAD3A | Синдром Хареля-Юна | AD/AR | 4 | 17 |
ATL1 | Спастическая параплегия, нейропатия, наследственная сенсорная | AD | 29 | 84 |
B4GALNT1 | Спастическая параплегия | AR | 7 | 13 |
BSCL2 | Липодистрофия врожденная генерализованная, Энцефалопатия прогрессирующая, Нейропатия, дистальная наследственная моторная, тип VA, болезнь Шарко-Мари-Тута 2 типа, Синдром Сильвера, Синдром спастической параплегии Серебра, Спастическая параплегия 17 | AD/AR | 34 | 50 |
BTD | Дефицит биотинидазы | AR | 170 | 247 |
C12ORF65 | Спастическая параплегия, комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования. | AR | 10 | 11 |
C19ORF12 | Спастическая параплегия, нейродегенерация с накоплением железа в мозгу. | AR | 15 | 37 |
CACNA1G | Спиноцеребеллярная атаксия 42 | 8 | 11 | |
CAPN1 | Спастическая параплегия 76, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 6 | 16 |
COASY | Нейродегенерация с накоплением железа в мозгу 6 | AR | 3 | 3 |
CTNNB1 | Экссудативная витреоретинопатия 7, Умственная отсталость, аутосомно-доминантный тип 19 | AD | 90 | 51 |
CYP27A1 | Церебротендинозный ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
CYP2U1 | Спастическая параплегия 56, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 14 | 19 |
CYP7B1 | Дефект синтеза желчных кислот, Спастическая параплегия 5А, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 18 | 60 |
DARS | Гипомиелинизация с поражением ствола головного мозга и спинного мозга и спастичностью ног. | AR | 11 | 17 |
DDHD1 | Спастическая параплегия | AR | 5 | 11 |
DDHD2 | Спастическая параплегия | AR | 18 | 19 |
ERLIN2 | Спастическая параплегия 18, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 7 | 13 |
FA2H | Спастическая параплегия | AR | 18 | 51 |
FARS2 | Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования 14, Спастическая параплегия 77, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 17 | 20 |
FXN | Атаксия Фридрейха | AR | 13 | 63 |
GALC | болезнь Краббе | AR | 107 | 243 |
GBA2 | Мозжечковая атаксия со спастичностью. | AR | 11 | 22 |
GBE1 | Болезнь накопления гликогена | AR | 36 | 70 |
GCH1 | Дофа-зависимая дистония Гиперфенилаланинемия, дефицит BH4, дефицит GTP-циклогидролазы 1 Дофа-зависимая дистония | AD/AR | 48 | 240 |
GJC2 | Спастическая параплегия Штрюмпеля, Лимфедема, наследственная, Лейкодистрофия, гипомиелинизирующая | AD/AR | 26 | 57 |
GPT2 | Умственная отсталость, аутосомно-рецессивный тип 49, микроцефалия, спастическая параплегия. | AR | 5 | 7 |
HACE1 | Спастическая параплегия и задержка психомоторного развития с судорогами или без них. | AR | 13 | 13 |
HSPD1 | Спастическая параплегия, лейкодистрофия, гипомиелинизирующая | AD/AR | 5 | 5 |
IBA57 | Синдром множественной митохондриальной дисфункции 3, Спастическая параплегия 74, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 14 | 23 |
IRF2BPL | Нарушение нервно-психического развития с гипотонией, судорогами и отсутствием речи. | AD | 9 | 2 |
KDM5C | Умственная отсталость синдромальная, Класа-Йенсена | XL | 47 | 55 |
KIAA0196 | Спастическая параплегия, синдром Ритчера-Шинцеля (синдром 3С) | AD/AR | 15 | 18 |
KIDINS220 | Спастическая параплегия, умственная отсталость, нистагм и ожирение (SINO) | AD/AR | 4 | 8 |
KIF1A | Спастическая параплегия, Невропатия, наследственная сенсорика, Нарушение интеллектуального развития | AD/AR | 63 | 42 |
KIF5A | Спастическая параплегия | AD | 18 | 62 |
L1CAM | Умственная отсталость, афазия, синдром шаркающей походки и отведенных больших пальцев (MASA), гидроцефалия вследствие врожденного стеноза сильвиева водопровода, спастический синдром, синдром CRASH, мозолистое тело, частичная агенезия | XL | 80 | 292 |
L2HGDH | L-2-гидроксиглутаровая ацидурия | AR | 15 | 79 |
MARS2 | Комбинированный дефицит окислительного фосфорилирования | AR | 8 | 5 |
NIPA1 | Спастическая параплегия | AD | 5 | 16 |
NKX6-2 | Спастическая атаксия 8, аутосомно-рецессивная, с гипомиелинизирующей лейкодистрофией. | AR | 4 | 8 |
NT5C2 | Спастическая параплегия 45 | AR | 8 | 7 |
PAH | Гиперфенилаланинемия, легкая форма ФКУ, фенилкетонурия | AR | 294 | 966 |
PLP1 | Спастическая параплегия, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера. | XL | 60 | 348 |
PNPLA6 | Синдром Лоуренса-Муна, синдром Баучера-Нойхаузера, спастическая параплегия 39 | AR | 26 | 58 |
RARS | Лейкодистрофия гипомиелинизирующая 9 | AR | 12 | 11 |
REEP1 | Спастическая параплегия, Дистальная наследственная моторная нейронопатия | AD | 16 | 60 |
RTN2 | Спастическая параплегия 12, аутосомно-доминантный тип. | AD | 4 | 5 |
SACS | Спастическая атаксия Шарлевуа-Сагенея. | AR | 254 | 262 |
SETX | Атаксия с глазодвигательной апраксией, боковой амиотрофический склероз, ювенильный, спиноцеребеллярная атаксия | AD/AR | 36 | 210 |
SLC16A2 | Синдром Аллана-Херндона-Дадли | XL | 39 | 84 |
SLC1A4 | Спастическая тетраплегия, истончение мозолистого тела и прогрессирующая микроцефалия. | AR | 4 | 8 |
SLC25A15 | Синдром гиперорнитинемии-гипераммониемии-гомоцитруллинемии | AR | 24 | 36 |
SLC33A1 | Врожденная катаракта, потеря слуха и нейродегенерация, Спастическая параплегия 42, аутосомно-доминантный тип. | AD/AR | 6 | 7 |
SPAST | Спастическая параплегия | AD | 193 | 723 |
SPG11 | Спастическая параплегия, боковой амиотрофический склероз, болезнь Шарко-Мари-Тута. | AR | 162 | 274 |
SPG20 | Спастическая параплегия (синдром Тройера) | AR | 9 | 7 |
SPG7 | Спастическая параплегия | AR | 69 | 111 |
SPR | Дистония, дофа-зависимая, из-за дефицита сепиаптеринредуктазы | AR | 12 | 23 |
TECPR2 | Спастическая параплегия 49, аутосомно-рецессивный тип. | AR | 9 | 6 |
TFG | Спастическая параплегия, Наследственная моторная и сенсорная нейропатия, проксимальная | AR | 4 | 7 |
TH | Синдром Сегавы, аутосомно-рецессивный | AR | 44 | 71 |
UBAP1 | Спастическая параплегия | AD | 1 | |
ZFYVE26 | Спастическая параплегия 15 | AR | 63 | 39 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.