Анализы ДНК в Украине
Все анализы/Панели (секвенирование NGS)
В панель „Панель аномальных гениталий/расстройств полового развития“ входит 73 гена, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеально подходит для пациентов с неоднозначными гениталиями, пациентов с подозрением на нарушение полового развития и пациентов с подозрением на врожденную гиперплазию надпочечников (ВГКН).
Нарушения полового развития (DSD) представляют собой группу врожденных состояний, характеризующихся проблемами в ходе формирования гонадного и полового развития. Было подсчитано, что от 1% до 2% живорожденных имеют какой-либо аспект DSD. Приблизительно 5% детей с DSD имеют неоднозначные гениталии и неопределенный пол при рождении. Однако подавляющему большинству этих пациентов не требуется корригирующая хирургия. Пациенты с DSD 46,XY часто имеют нарушения синтеза или действия андрогенов и могут иметь нормальные женские наружные половые органы, в то время как пациенты с DSD 46,XX состояниями часто имеют избыток андрогенов. У женщин 46,XX врожденная гиперплазия коры надпочечников (ВГН), вызванная дефицитом 21-гидроксилазы (21-OHD), является наиболее частой причиной DSD. По оценкам, распространенность ВГКН составляет 1:10 000, а 90-95% случаев связаны с мутациями CYP21A2. Тяжесть состояния часто зависит от остаточной ферментативной активности, подразделяющей мутации CYP21A2 на тяжелые (классический фенотип, ферментативная активность 0–10%) и легкие (неклассические, ферментативная активность 20–50%).
Синдром нечувствительности к андрогенам (AIS), вызванный мутациями в AR, характеризуется феминизацией наружных половых органов и атипичным половым развитием у лиц с кариотипом 46,XY. Состояние может быть полным, частичным или легким, в зависимости от уровня нечувствительности к андрогенам. Мутации в гене AR объясняют до 95% случаев полной нечувствительности к андрогенам, в то время как для частичного и легкого подтипов этот показатель ниже. Общая распространенность различных подтипов AIS оценивается как 5:100 000.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AMH | Синдром персистирующего мюллерова протока | AR | 5 | 56 |
AMHR2 | Синдром персистирующего мюллерова протока | AR | 6 | 37 |
ANOS1 | синдром Каллмана | XL/Digenic | 36 | 186 |
AR | Нечувствительность к андрогенам, гипоспадия 1, сцепленная с Х-хромосомой | XL | 147 | 612 |
ARX | Лиссэнцефалия, эпилептическая энцефалопатия, мозолистое тело, агенезия, с аномалиями гениталий, синдром Партингтона, синдром Прауда, гидранэнцефалия с аномалиями гениталий, умственная отсталость | XL | 66 | 93 |
ATRX | синдром Карпентера-Вазири, альфа-талассемия/синдром умственной отсталости, синдром Холмса-Ганга, синдром Джуберга-Марсиди, синдром Смита-Файнмана-Майерса, синдром умственной отсталости-гипотонического лица | XL | 65 | 165 |
BCOR | Микрофтальм, синдромальный, окулофациокардиодентальный синдром | XL | 40 | 53 |
CDK9 | AR | 1 | ||
CDKN1C | Синдром Беквита-Видеманна, синдром IMAGE | AD | 35 | 81 |
CEP41 | синдром Жубера | AR/Digenic | 7 | 11 |
CHD4 | Синдром Сифрима-Хитца-Вейса | AD | 14 | 21 |
CHD7 | Изолированный дефицит гонадотропин-рилизинг-гормона, CHARGE-синдром | AD | 276 | 860 |
CREBBP | Синдром Рубинштейна-Тайби | AD | 175 | 362 |
CYB5A | 46, XY нарушение развития пола, метгемоглобинемия, тип IV | AR | 3 | 5 |
CYP11A1 | Надпочечниковая недостаточность, врожденная, с изменением пола 46,XY, частичная или полная | AD/AR | 14 | 28 |
CYP11B1 | Гиперплазия надпочечников, врожденная, из-за дефицита 11-бета-гидроксилазы, корригируемый глюкокортикоидами альдостеронизм | AD/AR | 55 | 147 |
CYP17A1 | Врожденная гиперплазия надпочечников из-за дефицита 17-альфа-гидроксилазы | AR | 35 | 126 |
CYP19A1 | Дефицит ароматазы, синдром избытка ароматазы | AR | 17 | 52 |
CYP21A2 | Гиперплазия надпочечников, врожденная, обусловленная дефицитом 21-гидроксилазы, Гиперандрогения, неклассическая, обусловленная дефицитом 21-гидроксилазы | AR | 48 | 296 |
DHCR7 | Синдром Смита-Лемли-Опица | AR | 88 | 217 |
DHH | 46,XY частичная дисгенезия половых желез с минифасцикулярной невропатией, 46,XY реверсия пола 7 | AD/AR | 5 | 18 |
DYNC2H1 | Короткореберная дисплазия грудной клетки с полидактилией 1 типа или без нее, Короткореберная дисплазия грудной клетки с полидактилией 3 типа или без нее, Асфиксирующая грудная дисплазия (ATD; Jeune), SRPS тип 2 (Majewski) | AR/Digenic | 148 | 205 |
ERCC3 | пигментная ксеродерма, трихотиодистрофия, светочувствительность | AR | 10 | 19 |
FEZF1 | Гипогонадотропный гипогонадизм 22 с аносмией или без нее, синдром Каллмана | AR | 2 | 3 |
FGF17 | Гипогонадотропный гипогонадизм 20, с аносмией или без нее | AD/Multigenic | 2 | 5 |
FGF8 | Гипогонадотропный гипогонадизм | AD/Digenic | 18 | 36 |
FGFR1 | синдром Пфайффера, тригоноцефалия, гипогонадотропный гипогонадизм, остеоглофоническая карликовость - краниостеноз, синдром Хартсфилда | AD/Digenic/Multigenic | 72 | 257 |
FIG4 | Боковой амиотрофический склероз, полимикрогирия, двусторонняя затылочная, синдром Юниса-Варона, болезнь Шарко-Мари-Тута | AD/AR | 34 | 69 |
FRAS1 | Синдром Фрейзера | AR | 27 | 58 |
FSHB | Гипогонадотропный гипогонадизм 24 без аносмии | AR | 5 | 8 |
GATA4 | Тетрада Фалло, дефект атриовентрикулярной перегородки, аномалии яичек с врожденным пороком сердца или без него, дефект межжелудочковой перегородки, дефект межпредсердной перегородки | AD | 37 | 140 |
GNRH1 | Гипогонадотропный гипогонадизм 12 с аносмией или без нее | AR | 1 | 10 |
GNRHR | Гипогонадотропный гипогонадизм | AR | 23 | 58 |
HS6ST1 | Гипогонадотропный гипогонадизм 15, с аносмией или без нее, синдром Каллмана | AD | 7 | |
HSD17B3 | Нарушение развития нервной системы с гипотонией, неонатальной дыхательной недостаточностью и термодисрегуляцией | AR | 24 | 63 |
HSD3B2 | 3-бета-гидроксистероиддегидрогеназа, дефицит II | AR | 11 | 63 |
IL17RD | Гипогонадотропный гипогонадизм | AD/Digenic | 6 | 10 |
IRF6 | Орофациальная расщелина, синдром подколенного птеригиума, синдром Ван дер Вуда | AD | 45 | 338 |
KISS1 | Гипогонадотропный гипогонадизм 13 с аносмией или без нее, центральное преждевременное половое созревание | AR | 1 | 10 |
KISS1R | Преждевременное половое созревание, центральное 1 | AD/AR | 7 | 36 |
LEP | Дефицит лептина | AR | 5 | 20 |
LEPR | Дефицит рецептора лептина | AR | 4 | 30 |
LHB | Гипогонадотропный гипогонадизм 23 с аносмией или без нее | AR | 6 | 8 |
LHCGR | Преждевременное половое созревание, мужчины, гипоплазия клеток Лейдига, резистентность к лютеинизирующему гормону, женщины | AR | 34 | 76 |
MAMLD1 | Гипоспадия 2, сцепленная с Х-хромосомой | XL | 5 | 20 |
MAP3K1 | 46,XY смена пола 6 | AD | 9 | 27 |
MKRN3 | Центральное преждевременное половое созревание | AD | 6 | 32 |
MKS1 | синдром Барде-Бидля, синдром Меккеля | AR | 50 | 52 |
NR0B1 | Гипоплазия надпочечников, врожденная, смена пола 46, XY | XL | 73 | 252 |
NR5A1 | Надпочечниковая недостаточность, преждевременная недостаточность яичников, 46, XY смена пола | AD | 28 | 183 |
NSMF | Гипогонадотропный гипогонадизм 9 с аносмией или без нее | AD | 8 | |
POLR3B | Лейкодистрофия, гипомиелинизирующая | AR | 19 | 58 |
POR | Нарушение стероидогенеза из-за дефицита цитохрома р450 оксидоредуктазы, синдром Антли-Бикслера | AR | 14 | 70 |
PROK2 | Гипогонадизм, гипогонадотропный, синдром Каллмана | AR | 7 | 20 |
PROKR2 | Гипогонадотропный гипогонадизм | AR | 9 | 54 |
PROP1 | Дефицит гормонов гипофиза, комбинированный | AR | 33 | 37 |
RNF216 | Мозжечковая атаксия и гипогонадотропный гипогонадизм (синдром Гордона Холмса) | AR | 10 | 14 |
RSPO1 | Ладонно-подошвенный гиперкератоз с плоскоклеточным раком кожи и реверсией пола 46,XX | AR | 3 | 5 |
SAMD9 | синдром миража, опухолевой кальциноз, нормофосфатемия | AD/AR | 10 | 27 |
SGPL1 | Нефротический синдром 14 | AR | 8 | 17 |
SOX10 | Периферическая демиелинизирующая невропатия, центральная дисмиелинизация, синдром Ваарденбурга и болезнь Гиршпрунга, синдром Каллмана | AD | 56 | 148 |
SOX2 | Микрофтальм, синдромальный | AD | 34 | 104 |
SOX9 | Кампомелическая дисплазия, смена пола 46,XY, брахидактилия с анонихией (синдром Кука) | AD | 47 | 144 |
SRD5A2 | Дефицит стероидной 5-альфа-редуктазы 2 | AR | 45 | 119 |
SRY | 46,XX нарушение полового развития, 46,XY нарушение полового развития | YL | 29 | 109 |
STAR | Липоидная гиперплазия надпочечников | AR | 34 | 83 |
TAC3 | Гипогонадотропный гипогонадизм | AR | 5 | 10 |
TACR3 | Гипогонадотропный гипогонадизм | AR | 8 | 36 |
TOE1 | Мостомозжечковая гипоплазия 7 типа | 11 | 12 | |
TSPYL1 | Внезапная младенческая смерть при синдроме дисгенезии яичек, 46 лет, XY нарушение полового развития | AR | 1 | 8 |
WDR11 | Гипогонадотропный гипогонадизм, синдром Каллмана | AD | 3 | 17 |
WT1 | Синдром Дени-Драша, синдром Фрейзера, опухоль Вильмса, нефротический синдром, тип 4 | AD | 42 | 183 |
ZFPM2 | 46, XY смена пола, диафрагмальная грыжа 3, тетрада Фалло | AD/AR | 9 | 50 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.