Анализы ДНК в Украине
Киев
Все анализы/Хромосомные патологии
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА, Array-CGH, Microarray) - молекулярно-генетический метод анализа вариаций числа копий ДНК, позволяет с максимальной точностью исключить хромосомную патологию у обследуемого. Хромосомная патология - любое нарушение числа и/или структуры хромосом.
Хромосомный микроматричный анализ представляет собой мощное методологическое продвижение классической цитогенетики. С помощью ХМА делеции или дубликации геномных областей в хромосомном материале и, таким образом, может быть диагностирован дисморфизм, отставание в развитии, пороки развития. По сравнению с обычным хромосомным анализом (кариотипом), где предел обнаружения составляет от 5 до 10 Мб, микроматричный анализ обеспечивает обнаружение геномных дисбалансов с диагностическим разрешением от 50 до 100кб.
Чаще всего причиной множественных пороков развития являются средние и крупные микроделеции с вовлечением множества генов. Такие хромосомные изменения легко детектируются при помощи ХМА
При неспецифичном фенотипе пациента выбор таргетной диагностической панели вызывает трудности. Полногеномные методы в этом случае имеют преимущества. ХМА определяет вариации копий всех клинически значимых генов.
Наиболее частой причиной аутизма, умственной отсталости и задержки развития является хромосомная патология. ХМА в этом случае обладает высокой диагностической эффективностью по сравнению с другими методами
- Низкий вес при доношенной беременности;
- Малые аномалии развития (особенности фенотипа);
- Аномальное строение половых органов, неопределенный пол;
- Выраженные отклонения в росте (низкий рост, высокий рост) и размерах головы (микроцефалия, макроцефалия);
- Отставание в физическом и половом развитии;
- Первичная или вторичная аменорея, или ранняя менопауза;
- Аномальная спермограмма – азооспермия или выраженная олигозооспермия;
- Клинические проявления синдрома микроструктурной аномалии;
- Выявление маркерных хромосом или неидентифицируемых аномалий при стандартном анализе кариотипа;
- Аномальный кариотип у родителей
Традиционно первым тестом при подозрении на генетическую патологию был кариотип. Но кариотип определяет только те хромосомные патологии, которые видно в микроскоп. Сегодня ему на смену пришел хромосомный микроматричный анализ, который в 800 раз чувствительнее кариотипа и выявляет намного больше патологических изменений в геноме. Хромосомный микроматричный анализ - наиболее экономичный способ выявить хромосомную патологию и определить тактику дальнейшего обследования пациента.
| Классическое цитогенетическое исследование | Fish-метод | Хромосомный микроматричный анализ | |
|---|---|---|---|
| Начало применения метода | 1956 год | 1980 год | 2012 год |
| Диагностика анеуплоидий | 23 пары | Заданное количество хромосом, как правило не более 12 пар | 23 пары |
| Чувствительность определения делеций и дупликаций хромосомных локусов | При протяженности фрагмента от 10 000 000 п.н. | Требуется предварительный клинический диагноз | От 50 000 п.н. |
| Выявление потери гетерозиготности (LOH) | Нет | Нет | Да |
| Выявление сбалансированных хромосомных транслокации | Да | Да (требуется предположительный предполагаемый характер транслокации) | Нет |
| Количество синдромов, которые могут быть выявлены | Около 50 | Все известные, но при наличии предварительного диагноза | Любые известные и неизвестные (de novo) хромосомные синдромы |
Обнаружив микроделеции и микродупликации в геноме пациента, хромосомный микроматричный анализ может обнаружить значительные отклонения гораздо меньшего размера, чем обычный кариотип. Обычный хромосомный анализ выявляет структурные геномные изменения только у 3-4% обследованных пациентов с задержкой развития. Небольшое улучшение разрешения может быть достигнуто с помощью молекулярно-цитогенетических методов, таких как флуоресцентная гибридизация in situ или сокращенно FISH. С помощью диагностики FISH предварительно определенные области генома специально анализируются на наличие микроделеций и микродупликаций. ХМА анализирует весь геном и, таким образом, может показать значительно больше изменений в геноме. Хромосомный микроматричный анализ может выявить причинные изменения у 15% пациентов, он может разрешить неоднозначные случаи умственной отсталости или редких синдромальных состояний. Кроме того, потери или приобретения, обнаруженные при анализе хромосом, можно охарактеризовать более точно. С помощью ХМА можно сделать гораздо лучшее заявление о клинической значимости (корреляция генотип-фенотип).
В методе ХМА (array-CGH - сравнительная геномная гибридизация на основе массива) ДНК пациента и эталонная ДНК метятся различными флуоресцентными красителями и совместно гибридизуются на чипе-носителе с иммобилизованными фрагментами ДНК («зондами» или зондами). Эти зонды максимально равномерно охватывают геном человека. Численные изменения приводят к смещению цвета сигнала флуоресценции для отдельных зондов. Эти сигналы регистрируются с помощью лазерного сканера и соотносятся с соответствующей хромосомной областью и отображаются с помощью соответствующего программного обеспечения («молекулярное кариотипирование»). Обычно мы используем массив Agilent 180K с диагностическим разрешением >50kb. После консультации также возможен анализ отдельных массивов с высоким разрешением.
В некоторых случаях, по результатам ХМА может быть рекомендовано обследование родителей или других родственников пациента.
Лаборатория (Германия) поставляет только результаты наилучшего качества. Чтобы соответствовать самым высоким требованиям, она выполняет каждый шаг процесса от получения образца до создания окончательного отчета собственными силами. Действует по принципу четырех глаз, то есть отчет обязательно подписывает генетик и врач. Цель — предоставить наиболее подробные результаты для пациентов и данные самого высокого качества для дальнейших исследований. Стандарты гарантируют качество работы: аккредитация в соответствии с DIN EN ISO 15189 в качестве лаборатории генетической диагностики человека и американскими стандартами (CAP/CLIA).
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в вакуумную пробирку с EDTA К2 или К3 (фиолетовая/сиреневая крышка) 2*4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности.
Во всех случаях по результатам анализа необходимо получить консультацию врача-генетика.
При сдаче теста в городах кроме Киева - доплата 500 грн к заказу и срок + 3 дня.
