Анализы ДНК в Украине
Все анализы/Панели (секвенирование NGS)
В панель Врожденная диарея входит 29 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеально подходит для пациентов с клиническими подозрениями на хроническую диарею с ранним началом, врожденную пучковую энтеропатию/дисплазию кишечного эпителия или заболевание с включением микроворсинок.
Постоянная диарея и задержка развития могут быть вызваны наследственными диареями. Врожденные диареи представляют собой группу редких аутосомно-рецессивных энтеропатий с часто тяжелым исходом. Они могут проявляться пренатально с задержкой внутриутробного развития, но начало заболевания обычно происходит вскоре после родов и в редких случаях в срок до 3-4 месяцев. Диарея обычно бывает часто, и в зависимости от подтипа диареи стул может содержать высокие уровни натрия или хлорида, что приводит к обезвоживанию и дисбалансу электролитов. У пораженных младенцев часто наблюдается задержка развития, задержка развития, проблемы с печенью и почками и остеопороз. Генетические дефекты были описаны совсем недавно, поэтому клиническая полезность мультигенных NGS-панелей при этой группе заболеваний остается неизвестной.
Туфтинговая энтеропатия или кишечная эпителиальная дисплазия вызываются рецессивными мутациями EPCAM и являются наиболее частым заболеванием в этой категории с предполагаемой распространенностью 1:50 000-100 000. Он вызывает «неизлечимые» диареи, начинающиеся в раннем детстве и приводящие к задержке развития, полной зависимости от парентерального питания и, в конечном итоге, к необходимости трансплантации для лечения. Врожденная диарея 6 типа является единственным аутосомно-доминантным заболеванием, на которое направлена эта панель. Распространенность врожденных поносов наиболее высока в регионах с большим количеством кровнородственных браков.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADAM17 | Воспалительные заболевания кожи и кишечника у новорожденных 1 | AR | 1 | 7 |
ALPI | Воспалительное заболевание кишечника | AR | 5 | |
CYP27A1 | Церебротендинозный ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
DGAT1 | Диарея | AR | 7 | 11 |
EPCAM | Диарея 5, с тафтинговой энтеропатией, врожденная, колоректальный рак, наследственный неполипоз | AD/AR | 38 | 80 |
FOXP3 | Иммунодисрегуляция, полиэндокринопатия и энтеропатия | XL | 28 | 93 |
GUCY2C | Диарея, мекониальный илеус | AD/AR | 7 | 10 |
IL10 | Воспалительное заболевание кишечника | AD/AR | 1 | 5 |
IL10RA | Воспалительное заболевание кишечника | AR | 4 | 43 |
IL10RB | Воспалительное заболевание кишечника | AR | 2 | 19 |
IL21 | Иммунодефицит, общая переменная, 11 | AR | 1 | 1 |
LCT | Дефицит лактазы | AR | 11 | 15 |
LIPA | Болезнь Вольмана, болезнь накопления эфиров холестерина | AR | 27 | 93 |
MVK | Мевалоновая ацидурия, синдром гипер-IgD, порокератоз 3, несколько типов | AD/AR | 35 | 181 |
MYO5B | Диарея с атрофией микроворсинок | AR | 14 | 80 |
NCF2 | Хроническая гранулематозная болезнь | AR | 19 | 72 |
NEUROG3 | Диарея, мальабсорбция, врожденная | AR | 3 | 8 |
SAR1B | Болезнь задержки хиломикронов (болезнь Андерсона) | AR | 8 | 16 |
SI | Дефицит сахаразы-изомальтазы, врожденный | AR | 12 | 23 |
SKIV2L | Трихогепатоэнтеральный синдром 2 | AR | 6 | 33 |
SLC10A2 | Мальабсорбция желчных кислот, первичная | AD/AR | 2 | 4 |
SLC26A3 | Диарея, секреция хлоридов, врожденная | AR | 55 | 88 |
SLC5A1 | Мальабсорбция глюкозы/галактозы | AR | 3 | 58 |
SLC9A3 | Диарея, секреторная натриевая, врожденная | AR | 6 | 12 |
SPINT2 | Диарея, секреторная натриевая, врожденная | AR | 6 | 12 |
STX3 | Болезнь включения микроворсинок | AR | 3 | |
TTC37 | Трихогепатоэнтеральный синдром, синдром аутовоспалительной панцитопении | AR | 12 | 64 |
TTC7A | Желудочно-кишечные дефекты и синдром иммунодефицита | AR | 21 | 46 |
XIAP | Лимфопролиферативный синдром | XL | 14 | 96 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Специальной подготовки не требуется: не нужно натощак, обильно пить воду.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Забор материала у нас в центре или можно передать нам пробирку ЭДТА, взятую в любой лаборатории. О возможности забора у детей уточнять дополнительно.
В наших пунктах забора, кроме Киева, забор материала стоит .
Необходимо предоставить заключение врача с клинической картиной (описание симтомов, диагноз), заполнить в электронном виде анкету.
Анализ не проводится для здоровых людей без сипмтомов, в этом случае рекомендуются скрининговые анализы на носительство.
По результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.