Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Умственная отсталость и расстройства аутистического спектра" входит 75 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций (ХМА), наследуемый от матери митохондриальный геном.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на аутизм.
Расстройство аутистического спектра (РАС) — это нарушение развития нервной системы, характеризующееся дефицитом социального общения, отсутствием или задержкой речевого развития, а также стереотипным или повторяющимся поведением. У аутизма много этиологий, поскольку он был задокументирован в сотнях неврологических синдромов с множеством причин, исходов и реакций на лечение. В настоящее время генетическую причину можно выявить у 20-25% детей с аутизмом. Моногенные расстройства, при которых неврологические проявления связаны с расстройством аутистического спектра (РАС), могут быть идентифицированы примерно у 5% пациентов с РАС. Аутизм можно рассматривать как комплексный (т. е. наличие дисморфических признаков и/или микроцефалии) или эссенциальный (т. е. отсутствие физических аномалий и микроцефалии).
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADNP | Синдром Хельсмуртеля-ван дер Аа (умственная отсталость, аутосомно-доминантный 28) | AD | 44 | 66 |
BCL11A | Синдром Диаса-Логана | AD | 20 | 29 |
C12ORF4 | Задержка развития и судороги с двигательными нарушениями или без них (DEDSM) | AR | 1 | 5 |
CACNA1C | Синдром Бругада, синдром Тимоти, нарушение развития нервной системы | AD | 19 | 68 |
CC2D1A | Умственная отсталость, аутосомно-рецессивная 3 | AR | 3 | 7 |
CNOT3 | AD | 1 | 8 | |
CNTN6 | Задержка развития и судороги с двигательными нарушениями или без них (DEDSM) | AD | 2 | 41 |
COL4A3BP | Умственная отсталость, аутосомно-доминантный 34 | AD | 6 | 7 |
CSNK2A1 | AD | 14 | 20 | |
CTNND2 | Задержка развития и судороги с двигательными нарушениями или без них (DEDSM) | AD | 7 | 35 |
DHCR7 | Синдром Смита-Лемли-Опица | AR | 88 | 217 |
EHMT1 | Синдром Клифстры | AD | 86 | 89 |
EN2 | Аутизм | AD | 2 | |
FBXO11 | Нарушение интеллектуального развития | AD | 8 | 9 |
FOXP1 | Умственная отсталость с нарушением речи и аутистическими чертами, Врожденные пороки сердца | AD | 48 | 76 |
GAMT | Дефицит гуанидиноацетатметилтрансферазы | AR | 18 | 58 |
KMT2E | AD | 4 | ||
KMT5B | Задержка развития и судороги с двигательными аномалиями или без них (DEDSM), расстройство аутистического спектра, синдром избыточного роста с умственной отсталостью | AD | 9 | 14 |
MBOAT7 | Умственная отсталость, аутосомно-рецессивная 57 | AR | 5 | 5 |
MECP2 | Синдром Ангельмана, Аутизм, Синдром Ретта, Энцефалопатия, Умственная отсталость | XL | 506 | 1039 |
MT-ATP6 | Нейропатия, атаксия и пигментный ретинит, наследственная оптическая невропатия Лебера, атаксия и полинейропатия, взрослое начало, кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая, синдром Ли, стриатонигральная дегенерация, инфантильная, митохондриальная | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардиомиопатия, апикальная гипертрофическая и нейропатия, Кардиомиопатия, инфантильная гипертрофическая | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Миоглобинурия, рецидивирующая, наследственная оптическая нейропатия Лебера, сидеробластная анемия, дефицит цитохром-С-оксидазы, глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефицит цитохром с оксидазы | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефицит цитохром с оксидазы, наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Наследственная оптическая нейропатия Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, онкоцитома, наследственная оптическая нейропатия Лебера, атрофия и дистония зрительного нерва Лебера, дефицит митохондриального комплекса I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, митохондриальная | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичность/резистентность к хлорамфениколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Диабет-синдром глухоты, Митохондриальная миопатия, инфантильная, транзиторная, Митохондриальная миопатия при сахарном диабете | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, нефропатия, тубулоинтерстициальная, энцефалопатия, митохондриальная, эпилепсия, митохондриальная, миопатия, митохондриальная, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефицит цитохром-с-оксидазы, миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды, диабет-синдром глухоты, синдром циклической рвоты, СВДС | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Митохондриальное мультисистемное заболевание, прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальная миопатия, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, митохондриальное мультисистемное заболевание | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Энцефалопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Миоклоническая эпилепсия с рваными красными волокнами, митохондриальная миопатия, энцефалопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП), синдром Ли, митохондриальное мультисистемное заболевание, митохондриальная энцефаломиопатия с лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Ли, миопатия, митохондриальная | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Митохондриальное мультисистемное расстройство | Mitochondrial | 4 | |
NBEA | Эпилепсия | AD | 3 | 13 |
NFIB | Макроцефалия | AD | 17 | 2 |
NLGN3 | Аутизм, синдром Аспергера | XL | 2 | 10 |
NLGN4X | Аутизм, синдром Аспергера, умственная отсталость | XL | 7 | 35 |
NSD1 | синдром Сотоса, синдром Уивера, синдром Беквита-Видеманна | AD | 329 | 517 |
POGZ | Умственная отсталость, аутосомно-доминантный 37 (синдром Уайта-Саттона) | AD | 46 | 52 |
PTCHD1 | Предрасположенность к аутизму, сцепленный с Х-хромосомой 4 | XL | 9 | 47 |
PTEN | синдром Баннаяна-Райли-Рувалькаба, синдром Лермитта-Дюкло, синдром Каудена | AD | 435 | 638 |
RPL10 | Аутизм | XL | 4 | 5 |
SHANK3 | Синдром Фелана-Макдермида, шизофрения 15 | AD | 66 | 191 |
TBR1 | AD | 16 | 18 | |
TCF20 | Задержка развития и судороги с двигательными нарушениями или без них (DEDSM) | AD | 7 | 16 |
TRIP12 | Нарушение интеллектуального развития | AD | 14 | 32 |
TSC1 | Лимфангиолейомиоматоз, Туберозный склероз | AD | 177 | 372 |
TSC2 | Лимфангиолейомиоматоз, Туберозный склероз | AD | 396 | 1195 |
VAMP2 | AD | |||
WASF1 | Умственная отсталость и судороги | AD | 3 | 3 |
ZSWIM6 | Акрометический лобно-носовой дизостоз | AD | 4 | 2 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.