Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Эктодермальная дисплазия входит 25 генов, также включена оценка некодирующих вариантов.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на эктодермальную дисплазию (гидротическую или гипогидротическую) или синдром Эллиса-ван Кревельда.
Эктодермальная дисплазия (ED) представляет собой группу тесно связанных состояний, из которых идентифицировано более 150 различных синдромов. ED влияет на развитие или функцию зубов, волос, ногтей и потовых желез. ED может проявляться изолированно или как часть синдромального заболевания и обычно подразделяется на подтипы в зависимости от способности потоотделения. Клинические особенности Х-сцепленной и аутосомной форм гипогидротической эктодермальной дисплазии (HED) могут быть неразличимы, и многие из вовлеченных генов могут приводить к фенотипически различным результатам в зависимости от количества дефектных аллелей. Наиболее распространенными ED являются гипогидротическая ED и гидротическая ED. Х-сцепленная гипогидротическая эктодермальная дисплазия (HED) вызвана мутациями EDA и объясняет 75–95% семейной HED и 50% спорадических случаев. HED характеризуется тремя основными признаками: гипотрихозом (редкие, медленно растущие волосы и редкие/отсутствующие брови), сниженным потоотделением и гиподонтией (отсутствие или мелкие зубы). Снижение потоотделения создает риск эпизодов гипертермии. Женщины-носители могут иметь некоторую степень гиподонтии и легкий гипотрихоз. Описаны также изолированные зубные фенотипы. Мутации в WNT10A зарегистрированы у 9% людей с HED и у 25% людей с HED, у которых нет дефектов EDA. Примерно у 50% людей с гетерозиготной мутацией WNT10A имеется HED, и наиболее устойчивым клиническим признаком является тяжелая олигодентия постоянных зубов. Мутации EDAR объясняют 7% HED и связаны как с аутосомно-доминантной, так и с рецессивной ЭД. Эта панель обеспечивает дифференциальную диагностику, поскольку охватывает многие синдромы, которые могут проявляться при ЭД. Несколько синдромов, характеризующихся ED и потерей слуха, связаны с мутациями GJB2, включая синдром KID, синдром Вохвинкеля, синдром Барта-Памфри. Гидротическая ED 2-го типа обусловлена аутосомно-доминантными мутациями GJB6 и характеризуется гипотрихозом, дисплазией ногтей и ладонно-подошвенным гиперкератозом. В отличие от других эктодермальных дисплазий, потоотделение и развитие зубов являются нормальными. Рецессивные мутации EVC и EVC2 вызывают синдром Эллиса-ван Кревельда, характеризующийся ED, карликовостью, полидактилией и пороками сердца, однако доминантные мутации в тех же генах вызывают менее тяжелый акрофациальный дизостоз Вейерса. Выраженность ED, связанной с DSP, варьируется, включая курчавость волос, алопецию, гиперкератотические бляшки, задержку развития, дилатационную и аритмогенную кардиомиопатию правого желудочка. Наиболее тяжелым проявлением является летальный акантолитический буллезный эпидермолиз. Распространенность HED оценивается в 1:5 000–10 000 новорожденных, тогда как распространенность синдрома Эллиса-ван Кревельда составляет 1:60 000–200 000.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
BCS1L | Синдром Бьёрнстада, синдром GRACILE, синдром Ли, дефицит митохондриального комплекса III, ядерный тип 1 | AR | 42 | 37 |
CDH3 | Гипотрихоз врожденный с ювенильной макулярной дистрофией, эктодермальной дисплазией, эктродактилией и синдромом макулярной дистрофии | AR | 7 | 30 |
DSP | Кардиомиопатия расширенная с ворсистыми волосами, кератодермией и агенезией зубов, Аритмогенная дисплазия правого желудочка, семейная, Кардиомиопатия расширенная, с ворсистыми волосами и кератодермией, Ладонно-подошвенный полосатый кератоз II, Буллезный эпидермолиз, летальный акантолитический | AD/AR | 177 | 296 |
EDA | Эктодермальная дисплазия, гипогидротическая, агенезия зубов, селективная | XL | 115 | 326 |
EDAR | Эктодермальная дисплазия, ангидротическая, Морфология волос | AD/AR | 38 | 61 |
EDARADD | Эктодермальная дисплазия, ангидротическая, аутосомно-рецессивная, Эктодермальная дисплазия, ангидротическая, аутосомно-доминантная, Эктодермальная дисплазия, гипогидротическая, аутосомно-доминантная, Эктодермальная дисплазия, гипогидротическая, аутосомно-рецессивная | AD/AR | 8 | 10 |
ERCC2 | Пигментная ксеродерма, Трихотиодистрофия, фотосенсибилизация, Цереброкулофациоскелетный синдром 2 | AR | 26 | 98 |
EVC | Акрофациальный дизостоз Вейерса, синдром Эллиса-Ван Кревельда | AD/AR | 58 | 83 |
EVC2 | Синдром Эллиса-Ван Кревельда, акродентальный дизостоз Вейерса | AD/AR | 78 | 75 |
GJB2 | Синдром Барта-Памфри, Кератодермия ладонно-подошвенная с глухотой, Синдром Вохвинкеля, Гистрикс-подобный ихтиоз с глухотой, Синдром кератит-ихтиоз-глухота, Глухота аутосомно-рецессивный 1А | AD/AR/Digenic | 133 | 405 |
GJB6 | Глухота, аутосомно-доминантный тип 3В, Эктодермальная дисплазия, гидротическая (синдром Клоустона), Глухота, аутосомно-рецессивный тип 1В. | AD/AR | 10 | 33 |
HOXC13 | Эктодермальная дисплазия 9 | AR | 3 | 10 |
HR | Гипотрихоз 4, Атрихия с папулезными поражениями, Врожденная универсальная алопеция. | AD/AR | 15 | 52 |
IFT122 | Синдром Сенсенбреннера, краниоэктодермальная дисплазия (Левина-Сенсенбреннера) 1 типа, краниоэктодермальная дисплазия (Левина-Сенсенбреннера) 2 типа | AR | 13 | 23 |
JUP | Аритмогенная дисплазия правого желудочка, болезнь Наксоса | AD/AR | 8 | 46 |
LRP6 | Агенезия зубов, выборочная, 7 | AD | 19 | 37 |
MPLKIP | Трихотиодистрофия 4, нефоточувствительная | AR | 8 | 19 |
PAX9 | Агенезия зубов, избирательная, 3 | AD | 19 | 57 |
PORCN | Очаговая дермальная гипоплазия | XL | 16 | 121 |
PRKD1 | Врожденные пороки сердца и эктодермальная дисплазия. | AD | 2 | 7 |
PVRL4 | Синдром эктодермальной дисплазии-синдактилии 1 | AR | 6 | 10 |
RMRP | Хрящно-волосяная гипоплазия, Метафизарная дисплазия без гипотрихоза, Анауксетическая дисплазия | AR | 87 | 123 |
TP63 | Синдром Раппа-Ходжкина, орофациальная расщелина, синдром ВЗРОСЛЫХ, эктродактилия, эктодермальная дисплазия и синдром расщелины губы/неба, анкилоблефарон-эктодермальные дефекты – расщелина губы/неба, пороки развития раздвоенных рук/стоп, синдром конечностей-маммари | AD | 59 | 122 |
WDR35 | Краниоэктодермальная дисплазия (Левина-Сенсенбреннера) 1 тип, Краниоэктодермальная дисплазия (Левина-Сенсенбреннера) 2 типа, Синдром коротких ребер-полидактилии 5 типа | AR | 28 | 31 |
WNT10A | Одонтоониходермальная дисплазия, агенезия зубов, селективная, синдром Шопфа-Шульца-Пассарге | AD/AR | 23 | 81 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.