Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Гіпомагніємія входить 19 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на дефіцит магнію.
Сімейна гіпомагніємія з вторинною гіпокальціємією - рідкісне порушення всмоктування та транспорту мінералів, що характеризується дуже низьким рівнем магнію в сироватці. Гіпокальціємія є вторинним наслідком недостатності паращитовидних залоз та резистентності до паратиреоїдного гормону внаслідок тяжкого дефіциту магнію. Вона також може супроводжуватись гіпокаліємією. Гіпомагніємія може призвести до порушень практично в кожній системі органів і може спричинити потенційно фатальні ускладнення (наприклад, шлуночкову аритмію, спазм коронарних артерій та раптову смерть). Захворювання зазвичай проявляється у перші місяці життя генералізованими судомами або ознаками підвищеної нервово-м'язової збудливості, такими як спазми м'язів або тетанія. Без лікування захворювання може бути фатальним або призвести до тяжких неврологічних ушкоджень. Тяжкість клінічних проявів та вік початку варіюються залежно від залученого транспортера та типу спадкування. Лікування включає негайне введення магнію, зазвичай внутрішньовенно, з подальшим довічним прийомом високих доз перорального магнію. Гіпомагніємія - генетично гетерогенний розлад. Сімейна втрата Mg2+ нирками передбачає генетичну причину, і подальші дослідження в цих гіпомагніємічних сім'ях виявили більше дюжини генів, що безпосередньо чи опосередковано беруть участь у транспорті Mg2+. Їх можна розділити на чотири групи: гіперкальціуричні гіпомагніємії (включаючи мутації в CLDN16, CLDN19, CASR, CLCNKB), гіпомагніємії типу Гітельмана (CLCNKB, SLC12A3, BSND, KCNJ10, FYXD2, HNF1B, PCBD1), мітохоній 2, EGF, EGFR, KCNA1, FAM111A). Ниркова реабсорбція Mg відбувається в петлі Генлі за допомогою пасивного парацелюлярного транспортного процесу, в якому беруть участь клаудин-16 і клаудин-19, в той час як в кишечнику та в дистальному звивистому канальці (DCT) реабсорбція досягається за допомогою активного процесу, опосередкованого TRPM6. Інші гени, що кодують ключові білки з прямою або непрямою участю в активній обробці Mg, включають CNNM2, EGF, FXYD2, KCNA1 та HNF1B. Деякі спадкові захворювання нирок також часто пов'язані з гіпомагніємією, такі як тубулопатії із втратою солі: класичний синдром Барттера, синдром Гітельмана, синдром EAST, ниркові кісти та діабетичний синдром та аутосомно-домінантна гіпокальціємія.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкування* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
BSND | Нейросенсорна глухота з легкою нирковою дисфункцією, синдром Барттера | AR | 10 | 20 |
CASR | Гіпокальціємія, неонатальний гіперпаратиреоз, сімейна гіпокальціурична гіперкальціємія з транзиторним неонатальним гіперпаратиреозом | AD/AR | 104 | 396 |
CLCNKB | синдром Барттера | AR | 19 | 119 |
CLDN16 | Гіпомагніємія, ниркова | AR | 21 | 62 |
CLDN19 | Гіпомагніємія, ниркова | AR | 7 | 20 |
CNNM2 | Гіпомагніємія, ниркова гіпомагніємія, судоми та розумова відсталість | AD/AR | 5 | 6 |
CNNM4 | синдром Джалілі | AR | 11 | 24 |
EGF | Гіпомагніємія, ниркова | AR | 1 | 4 |
FAM111A | Синдром Кенні-Кефі, тип 2 | AD | 5 | 9 |
FXYD2 | Гіпомагніємія, ниркова | AD | 1 | 1 |
HNF1B | Нірково-клітинна карцинома, непапілярний хромофоб, ниркові кісти та діабетичний синдром | AD | 35 | 234 |
KCNA1 | Синдром епізодичної атаксії/міокімії | AD | 24 | 45 |
KCNJ10 | Судороги, нейросенсорна глухота, атаксія, розумова відсталість та порушення електролітного балансу (синдром SESAME), синдром Пендреда, розширення вестибулярного водопроводу | AR/Digenic | 13 | 29 |
MAGT1 | Імунодефіцит з дефіцитом магнію, інфекція вірусу Епштейна-Барр та неоплазія, розумова відсталість, зчеплена з Х-хромосомою 95 | XL | 8 | 14 |
NIPA2 | Гіпомагніємія | AD/AR | 1 | 4 |
PCBD1 | Гіперфенілаланінемія, дефіцит BH4 | AR | 6 | 11 |
SARS2 | Гіперурикемія, легенева гіпертензія, ниркова недостатність та алкалоз | AR | 6 | 5 |
SLC12A3 | синдром Гітельмана | AR | 49 | 489 |
TRPM6 | Гіпомагніємія, кишкова | AR | 15 | 61 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз виявив варіанти, що є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Натще не потрібно, рясно пити воду.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Забір матеріалу у нас у центрі або можна передати нам пробірку ЕДТА, взяту у будь-якій лабораторії. Про можливість забору у дітей уточнювати додатково.
У наших пунктах забору крім Києва забор матеріалу коштує .
Необхідно надати висновок лікаря з клінічною картиною (опис симтомів, діагноз), заповнити в електронному вигляді анкету.
Аналіз не проводиться для здорових людей без симптомів, у цьому випадку рекомендуються скринінгові аналізи на носійство.
За результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.