Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
Представляет собой панель из 24 генов, которая включает оценку некодирующих вариантов. Идеально подходит для пациентов с клиническим диагнозом или подозрением на лиссэнцефалию.
Лиссэнцефалия представляет собой группу редких пороков развития, объединенных общим признаком аномалий в виде извилин головного мозга, характеризующихся упрощением или отсутствием складчатости, связанных с аномальной организацией слоев коры. Лиссэнцефалия относится к «гладкому мозгу» с отсутствием извилин (агирия) или аномально широкими извилинами (пахигирия).
Классическая лиссэнцефалия (ранее тип I) представляет собой порок развития головного мозга, вызванный аномальной миграцией нейронов на сроке от 9 до 13 недель беременности, что приводит к спектру агирии, смешанной агирии/пахигирии и пахигирии. Он характеризуется аномально толстой и плохо организованной корой с четырьмя примитивными слоями (вместо шести в норме), диффузной гетеротопией нейронов, увеличенными и дисморфными желудочками и часто гипоплазией мозолистого тела.
У детей с лиссэнцефалией отмечаются проблемы с кормлением и глотанием, аномалии мышечного тонуса (ранняя гипотония, а затем гипертонус конечностей), судороги (в частности, инфантильные спазмы) и выраженная психомоторная заторможенность.
Описано несколько типов лиссэнцефалии, хотя они имеют перекрывающиеся черты: классическая лиссэнцефалия (гены LIS1 (PAFAH1B1), гены DCX и TUBA1A с аутосомно-доминантным и Х-сцепленным наследованием), лиссэнцефалия с гипоплазией мозжечка, тубулиновый тип ( TUBA1A и TUBB2B , аутосомно-доминантный), лиссэнцефалия с гипоплазией мозжечка, рилинопатический тип ( RELN и VLDLR , аутосомно-рецессивный) , корковая мальформация булыжникового типа ( FKTN, LARGE и POMT1 , AR) и лиссэнцефалия с агенезией мозолистого тела ( ARX , Х-сцепленный). Наиболее распространены классическая лиссэнцефалия и булыжниковая. Частота всех форм лиссэнцефалии I типа составляет около 1/100 000 новорожденных.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ACTB | Синдром Барайтсера-Винтера | AD | 55 | 60 |
ACTG1 | Глухота, синдром Барайтсера-Винтера | AD | 27 | 47 |
ARX | Лиссэнцефалия, эпилептическая энцефалопатия, мозолистое тело, агенезия, с аномалиями гениталий, синдром Партингтона, синдром Прауда, гидранэнцефалия с аномалиями гениталий, умственная отсталость | XL | 66 | 93 |
ATP6V0A2 | Cutis laxa, синдром морщинистой кожи | AR | 16 | 56 |
CIT | Микроцефалия 17, первичная, аутосомно-рецессивная | AR | 9 | 14 |
CRADD | Умственная отсталость, аутосомно-рецессивная 34, с вариантной лиссэнцефалией | AR | 4 | 6 |
DCX | Лиссэнцефалия, субкортикальная ламинальная гетеротопия | XL | 131 | 142 |
FKTN | Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия, дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), мышечная дистрофия-дистрогликанопатия (конечностно-поясная) | AD/AR | 45 | 58 |
ISPD | Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия | AR | 38 | 53 |
KATNB1 | Лиссэнцефалия 6, с микроцефалией | AR | 6 | 10 |
KIAA1109 | Черепно-лицевой дисморфизм, скелетные аномалии и синдром умственной отсталости | AR | 7 | 16 |
LAMB1 | Лиссэнцефалия 5 | AR | 8 | 7 |
LARGE | Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия | AR | 19 | 27 |
MACF1 | лиссэнцефалия | AD | 1 | 9 |
PAFAH1B1 | Лиссэнцефалия, подкорковая ламинарная гетеротопия | AD | 121 | 169 |
POMGNT2 | Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия (врожденная с аномалиями головного мозга и глаз), тип А, 8 | AR | 6 | 9 |
POMT1 | Мышечная дистрофия-дистрогликанопатия | AR | 47 | 96 |
RELN | Лиссэнцефалия, эпилепсия, семейная височная доля | AD/AR | 25 | 44 |
TMTC3 | Лиссэнцефалия 8 | 6 | 10 | |
TUBA1A | лиссэнцефалия | AD | 69 | 65 |
TUBB2B | Полимикрогирия, асимметричная | AD | 21 | 30 |
TUBG1 | Корковая дисплазия комплексная с другими пороками развития головного мозга 4 | AD | 5 | 3 |
VLDLR | Мозжечковая атаксия, умственная отсталость и синдром неравновесия | AR | 11 | 24 |
YWHAE | Синдром дистальных микроделеций 17p13.3, эндометриальная стромальная саркома, синдром микродупликации 17p13.3, синдром Миллера-Дикера | AD/AR | 12 | 44 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.