Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Нефролитиаз (почечнокаменная болезнь)" входит 45 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Нефролитиаз (почечнокаменная болезнь) является частым заболеванием с распространенностью от 5 до 10% в общей популяции. Обычно это связано с метаболическими нарушениями, которые могут включать гиперкальциурию, гиперфосфатурию, гипероксалурию, гипоцитратурию, гиперурикозурию, цистинурию, низкий объем мочи и дефект подкисления мочи. Считается, что генетические факторы, а также факторы окружающей среды способствуют его патогенезу. Гиперкальциурический нефролитиаз является семейным заболеванием более чем у 35% пациентов. Моногенные формы гиперкальциурического нефролитиаза включают синдром Барттера, болезнь Дента, аутосомно-доминантную гипокальциемическую гиперкальциурию, гиперкальциурический нефролитиаз с гипофосфатемией и семейную гипомагниемию с гиперкальциурией. Гены, связанные с нефролитиазом, кодируют белки, включая ряд транспортеров, каналов и рецепторов, которые участвуют в регуляции реабсорбции кальция, фосфатов в почечных канальцах и активности ингибиторов преципитации. Большинство (от 65% до 75%) камней состоят либо из чистых, либо в основном из солей кальция, в том числе из оксалата кальция, смеси оксалата кальция с мочевой кислотой и фосфата кальция (брушит). Остальную часть камней составляют мочевая кислота, цистин и фосфат магния-аммония (струвит). Состав камня отражает метаболические нарушения в моче. Лечение основано на диагнозе, и генетическое тестирование может помочь, поскольку биохимическое тестирование обычно не приводит к точному молекулярному диагнозу. Экологические и особенно диетические факторы важны как для первичной, так и для вторичной профилактики.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ADCY10 | Абсорбционная гиперкальциурия | AD | 6 | |
AGXT | Гипероксалурия | AR | 190 | 205 |
ALPL | Одонтогипофосфатазия, гипофосфатазия перинатальная летальная, инфантильная, ювенильная и взрослая формы | AD/AR | 78 | 291 |
APRT | Дефицит аденинфосфорибозилтрансферазы | AR | 11 | 47 |
ATP6V0A4 | Почечный тубулярный ацидоз, дистальный | AR | 16 | 84 |
ATP6V1B1 | Почечный тубулярный ацидоз с глухотой | AR | 15 | 56 |
ATP7B | болезнь Вильсона | AR | 219 | 897 |
BSND | Нейросенсорная глухота с легкой почечной дисфункцией, синдром Барттера | AR | 10 | 20 |
CA2 | Остеопетроз с ацидозом почечных канальцев | AR | 9 | 31 |
CASR | Гипокальциемия, неонатальный гиперпаратиреоз, семейная гипокальциурическая гиперкальциемия с транзиторным неонатальным гиперпаратиреозом | AD/AR | 104 | 396 |
CLCN5 | Протеинурия, низкомолекулярная, с гиперкальциурическим нефрокальцинозом, Гипофосфатемический рахит, Нефролитиаз, I, Болезнь Дента | XL | 48 | 272 |
CLCNKA | синдром Бартера | AR/Digenic | 3 | 3 |
CLCNKB | синдром Бартера | AR/Digenic | 19 | 119 |
CLDN16 | Гипомагниемия, почечная | AR | 21 | 62 |
CLDN19 | Гипомагниемия, почечная | AR | 7 | 20 |
CLPB | 3-метилглутаконовая ацидурия с катарактой, поражением нервной системы и нейтропенией (MEGCANN) | AR | 26 | 25 |
CYP24A1 | Гиперкальциемия, инфантильная 1 | AR | 8 | 40 |
FAM20A | Несовершенный амелогенез (эмалево-почечный синдром) | AR | 19 | 41 |
FOXI1 | Синдром Пендреда, увеличенный вестибулярный водопровод | AR | 1 | 11 |
GNA11 | Гипокальциемия, Гипокальциурическая гиперкальциемия | AD | 11 | 11 |
GPHN | Гиперэкплексия, дефицит кофактора молибдена | AD/AR | 35 | 20 |
GRHPR | Гипероксалурия | AR | 60 | 40 |
HNF4A | Врожденный гиперинсулинизм, чувствительный к диазоксиду, диабет зрелого возраста у молодых, ренотубулярный синдром Фанкони 4 с диабетом зрелого возраста у молодых | AD | 32 | 147 |
HOGA1 | Гипероксалурия | AD/AR | 37 | 33 |
HPRT1 | Синдром Леша-Нихана, синдром Келли-Сигмиллера | XL | 72 | 427 |
KCNJ1 | Синдром Барттера, антенатальный | AR | 11 | 66 |
MAGED2 | Синдром Барттера 5 типа, преходящий антенатальный | XL | 6 | 7 |
MOCOS | Ксантинурия II типа | AR | 3 | 5 |
MOCS1 | Дефицит кофактора молибдена | AR | 7 | 35 |
MOCS2 | Дефицит кофактора молибдена | AR | 10 | 16 |
OCRL | Синдром Лоу, болезнь Дента | XL | 47 | 264 |
PRPS1 | Сверхактивность фосфорибозилпирофосфатсинтетазы I, синдром Артса, болезнь Шарко-Мари-Тута, Х-сцепленный рецессивный, 5, Глухота, Х-сцепленный 1 | XL | 27 | 32 |
SLC12A1 | Синдром Барттера, антенатальный | AR | 18 | 81 |
SLC22A12 | Гипоурикемия, почечная 1 | AR | 8 | 40 |
SLC26A1 | Нефролитиаз, оксалат кальция | AR | 18 | 5 |
SLC2A9 | Гипоурикемия, почечная, 2 | AD/AR | 9 | 20 |
SLC34A1 | Нефролитиаз/остеопороз, гипофосфатемия, ренотубулярный синдром Фанкони, гиперкальциемия, инфантильная 2 | AD/AR | 22 | 29 |
SLC34A3 | Гипофосфатемический рахит с гиперкальциурией | AR | 22 | 38 |
SLC3A1 | Цистинурия | AR | 26 | 241 |
SLC4A1 | Сфероцитоз, овальцитоз, почечный канальцевый ацидоз, дистальный, с гемолитической анемией, криогидроцитоз, акантоцитоз, полоса 3 Мемфиса | AD/AR/BG | 38 | 122 |
SLC7A9 | Цистинурия | AD/AR | 24 | 159 |
SLC9A3R1 | Нефролитиаз/остеопороз, гипофосфатемия, 2 | AD | 7 | |
UMOD | Семейная ювенильная гиперурикемическая нефропатия, Гломерулокистозная болезнь почек с гиперурикемией и изостенурией, Медуллярная кистозная болезнь почек 2 | AD | 33 | 108 |
VDR | Витамин D-зависимый рахит | AD/AR | 17 | 66 |
XDH | Ксантинурия I типа | AR | 10 | 21 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.