Анализы ДНК в Украине
Все анализы/Панели (секвенирование NGS)
Это панель из 102 генов, включающая делеции, дупликации, оценку некодирующих вариантов.
Идеально подходит для пациентов с клиническим подозрением на лизосомальные заболевания накопления, муколипидозы, мукополисахаридоз, расстройства накопления гликопротеинов или расстройства накопления липидов. Гены на этой панели включены в расширенную панель метаболизма.
Было идентифицировано около 50 различных лизосомных болезней накопления. Эти нарушения вызываются мутациями, которые приводят к дефициту или снижению активности внутриклеточных ферментов, катаболизирующих биологические макромолекулы. Лизосомные болезни накопления вызываются лизосомальной дисфункцией в результате дефицита одного фермента, необходимого для метаболизма липидов, гликопротеинов или мукополисахаридов. Отсутствие или нарушение эффективности этих ферментов приводит к накоплению специфических макромолекулярных соединений в лизосомах в различных тканях и органах, вызывая прогрессирующие повреждения, которые при некоторых заболеваниях могут стать опасными для жизни. Хотя каждая болезнь по отдельности встречается редко, как группа они имеют заболеваемость частоту примерно 1/7000-8000 при рождении, в зависимости от разных популяций.
Лизосомные болезни накопления могут проявляться по-разному в инфантильной, ювенильной или взрослой формах. При заболеваниях, начинающихся во взрослом возрасте, патогенез обычно протекает медленнее, чем при инфантильных или ювенильных формах, и может включать периферические симптомы и симптомы со стороны ЦНС, тогда как инфантильные и ювенильные формы часто включают прогрессирующее поражение центральной нервной системы в дополнение к периферическим симптомам. Лизосомные болезни накопления проявляют клиническую гетерогенность. Симптоматическая патология может зависеть от типа мутации и уровней остаточных ферментов.
Большинство наследуются аутосомно-рецессивно, однако некоторые из них наследуются рецессивно, сцеплено с Х-хромосомой, например, болезнь Фабри и синдром Хантера. Другими примерами, охватываемыми этой панелью, являются болезнь Гоше (наиболее распространенная лизосомная болезнь накопления), болезнь Тея-Сакса, болезнь Помпе типа II, болезнь Салла, болезнь Краббе и болезнь Герлера. Ферментозаместительная терапия в настоящее время доступна для шести лизосомных болезней накопления, обычно используемая на протяжении всей жизни с особыми методами лечения для каждой из них.
Ген | Ассоциированный фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ABCC8 | Гиперинсулинемическая гипогликемия, Диабет, постоянный неонатальный, Гипогликемия, индуцированная лейцином, Сахарный диабет, транзиторный неонатальный, Легочная артериальная гипертензия (ЛАГ) | AD/AR | 170 | 641 |
ACY1 | Дефицит аминоацилазы 1 | AR | 5 | 14 |
ADAMTSL2 | Гелеофизическая дисплазия 3 | AR | 8 | 28 |
ADSL | Дефицит аденилосукциназы | AR | 24 | 57 |
AGA | Аспартилглюкозаминурия | AR | 48 | 37 |
ALDH5A1 | Дефицит янтарной полуальдегиддегидрогеназы | AR | 16 | 70 |
ALDH7A1 | Эпилепсия, пиридоксин-зависимая | AR | 52 | 123 |
AMT | Глициновая энцефалопатия | AR | 42 | 95 |
ANTXR2 | Гиалиноз, младенческий системный, фиброматоз, ювелин гиалиновый | AR | 17 | 47 |
ARG1 | Гипераргининемия | AR | 28 | 54 |
ARSA | Метахроматическая лейкодистрофия | AR | 113 | 246 |
ARSB | Мукополисахаридоз (Марото-Лами) | AR | 118 | 201 |
ASAH1 | Спинальная мышечная атрофия с прогрессирующей миоклонической эпилепсией, липогранулематоз Фарбера | AR | 16 | 71 |
ASPA | Дефицит аспартоацилазы (болезнь Канавана) | AR | 54 | 102 |
ATP13A2 | Болезнь Паркинсона (синдром Куфора-Ракеба) | AR | 21 | 40 |
BTD | Дефицит биотинидазы | AR | 170 | 247 |
CLN3 | Нейрональный цероидный липофусциноз 3 типа | AR | 100 | 72 |
CLN5 | Нейрональный цероидный липофусциноз 5 типа | AR | 62 | 47 |
CLN6 | Нейрональный цероидный липофусциноз 6 типа | AR | 41 | 83 |
CLN8 | Нейрональный цероидный липофусциноз 8 типа | AR | 45 | 44 |
COL11A2 | синдром Вейсенбахера-Цвеймюллера, глухота, отоспондиломегаэпифизарная дисплазия, фиброхондрогенез, синдром Стиклера 3 типа (неокулярный) | AD/AR | 29 | 57 |
COL2A1 | Аваскулярный некроз головки бедренной кости, регматогенная отслойка сетчатки, эпифизарная дисплазия с миопией и глухотой, чешская дисплазия, ахондрогенез 2 типа, платиспондилическая дисплазия типа Торранса, гипохондрогенез, врожденная спондилоэпифизарная дисплазия (ВЭДК), спондилоэпиметафизарная дисплазия (СЭМД) типа Струдвика, дисплазия Книста, Спондилопериферическая дисплазия, СЭД легкой степени с преждевременным началом артроза, СЭД с укорочением плюсневых костей, синдром Стиклера 1 типа | AD | 180 | 561 |
CTNS | Цистиноз | AR | 76 | 148 |
CTSA | галактосиалидоз | AR | 17 | 38 |
CTSC | Пародонтит, юношеский, синдром Хаима-Мунка, синдром Папийона-Лефевра | AR | 19 | 92 |
CTSD | Цероидный липофусциноз, нейрональный | AR | 12 | 18 |
CTSK | Пикнодизостоз | AR | 35 | 58 |
DHCR7 | Синдром Смита-Лемли-Опица | AR | 88 | 217 |
DPYD | Токсичность 5-фторурацила, задержка развития с дисморфическим лицом или без него и аутизм | AD/AR | 62 | 86 |
DYM | Дисплазия Диггве-Мельхиора-Клаузена, дисплазия Смита-МакКорта | AR | 22 | 34 |
ETFA | Глутаровая ацидурия, множественный дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы | AR | 8 | 29 |
ETFB | Глутаровая ацидурия, множественный дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы | AR | 6 | 15 |
ETFDH | Глутаровая ацидурия, множественный дефицит ацил-КоА-дегидрогеназы | AR | 43 | 190 |
FH | Наследственный лейомиоматоз и почечно-клеточный рак | AD/AR | 178 | 207 |
FOLR1 | Церебральный дефицит фолиевой кислоты | AR | 10 | 28 |
FUCA1 | Фукозидоз | AR | 19 | 33 |
GAA | Болезнь накопления гликогена | AR | 193 | 573 |
GALC | болезнь Краббе | AR | 107 | 243 |
GALNS | Мукополисахаридоз (синдром Моркио) | AR | 53 | 334 |
GAMT | Дефицит гуанидиноацетатметилтрансферазы | AR | 18 | 58 |
GBA | болезнь Гоше | AR | 84 | 488 |
GCDH | Глутаровая ацидурия | AR | 90 | 241 |
GLA | Болезнь Фабри | XL | 226 | 937 |
GLB1 | GM1-ганглиозидоз, мукополисахаридоз (синдром Моркио) | AR | 90 | 220 |
GLDC | Глициновая энцефалопатия | AR | 139 | 425 |
GM2A | GM2-ганглиозидоз, вариант AB | AR | 10 | 12 |
GNE | Проксимальная миопатия и офтальмоплегия, миопатия Нонака, сиалурия | AD/AR | 78 | 214 |
GNPTAB | Муколипидоз | AR | 166 | 184 |
GNPTG | Муколипидоз | AR | 45 | 46 |
GNS | Мукополисахаридоз (синдром Санфилиппо) | AR | 7 | 25 |
GPC3 | Синдром Симпсона-Голаби-Бемеля | XL | 33 | 75 |
GUSB | Мукополисахаридоз | AR | 27 | 62 |
HEXA | Болезнь Тея-Сакса, GM2-ганглиозидоз, дефицит гексозаминидазы А | AR | 128 | 194 |
HEXB | болезнь Сандхоффа | AR | 55 | 120 |
HGSNAT | Мукополисахаридоз (синдром Санфилиппо), пигментный ретинит | AR | 43 | 72 |
HRAS | Синдром Костелло, врожденная миопатия с избытком мышечных веретен | AD | 43 | 31 |
HYAL1 | Мукополисахаридоз | AR | 2 | 3 |
IDS | Мукополисахаридоз | XL | 85 | 637 |
IDUA | Мукополисахаридоз | AR | 105 | 282 |
L2HGDH | L-2-гидроксиглутаровая ацидурия | AR | 15 | 79 |
LAMA2 | Мышечная дистрофия, врожденная мерозин-дефицитная | AR | 199 | 301 |
LAMP2 | Данон болезнь | XL | 62 | 101 |
LDB3 | Дилатационная кардиомиопатия (ДКМП), миопатия, миофибриллярная | AD | 9 | 14 |
LIPA | Болезнь Вольмана, болезнь накопления эфиров холестерина | AR | 27 | 93 |
MAN1B1 | Умственная отсталость | AR | 8 | 26 |
MAN2B1 | Маннозидоз, альфа-В, лизосомальный | AR | 63 | 149 |
MANBA | Маннозидоз, лизосомальный | AR | 16 | 19 |
MCOLN1 | Муколипидоз | AR | 52 | 36 |
MFSD8 | Цероидный липофусциноз, нейрональный | AR | 27 | 47 |
MOCS1 | Дефицит кофактора молибдена | AR | 7 | 35 |
MOCS2 | Дефицит кофактора молибдена | AR | 10 | 16 |
MYOT | Миопатия, миофибриллярная, Мышечная дистрофия, конечностно-поясная, 1А, Миопатия, сфероидное тело | AD | 6 | 16 |
NAGA | Болезнь Канзаки, дефицит альфа-н-ацетилгалактозаминидазы, болезнь Шиндлера I типа, болезнь Шиндлера III типа | AR | 7 | 10 |
NAGLU | Мукополисахаридоз (синдром Санфилиппо), болезнь Шарко-Мари-Тута, аксональный, тип 2V | AR | 74 | 171 |
NEU1 | Сиалидоз | AR | 22 | 62 |
NPC1 | Болезнь Ниманна-Пика | AR | 164 | 472 |
NPC2 | Болезнь Ниманна-Пика | AR | 21 | 27 |
PEX1 | Синдром Геймлера, нарушение фактора биогенеза пероксисом 1A, нарушение фактора биогенеза пероксисом 1B | AR | 112 | 134 |
PEX10 | Адренолейкодистрофия, неонатальный, синдром Зеллвегера, нарушение биогенеза пероксисом, атаксия | AR | 34 | 29 |
PEX12 | Синдром Зеллвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 43 | 37 |
PEX13 | Адренолейкодистрофия, неонатальный, синдром Зельвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 9 | 10 |
PEX16 | Синдром Зеллвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 8 | 13 |
PEX26 | Адренолейкодистрофия, неонатальный, синдром Зельвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 13 | 27 |
PEX3 | Синдром Зеллвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 4 | 10 |
PEX5 | Адренолейкодистрофия, неонатальная, ризомелическая точечная хондродисплазия, синдром Зеллвегера, нарушение биогенеза пероксисом | AR | 8 | 14 |
PEX6 | Синдром Геймлера, нарушение биогенеза пероксисом 4A, нарушение биогенеза пероксисом 4B | AR | 58 | 107 |
PGK1 | Дефицит фосфоглицераткиназы 1 | XL | 16 | 26 |
PHYH | Болезнь Рефсума | AR | 12 | 36 |
PPT1 | Цероидный липофусциноз, нейрональный | AR | 94 | 77 |
PRODH | Гиперпролинемия | AR | 52 | 10 |
PSAP | Болезнь Краббе, атипичная, Метахроматическая лейкодистрофия, обусловленная дефицитом сапозина-В, Комбинированная недостаточность сапозина, Болезнь Гоше, атипичная, обусловленная дефицитом сапозина С | AR | 18 | 26 |
QDPR | Гиперфенилаланинемия, дефицит BH4 | AR | 14 | 66 |
RAI1 | Синдром Смита-Магениса | AD | 37 | 112 |
SGSH | Мукополисахаридоз (синдром Санфилиппо) | AR | 55 | 148 |
SLC17A5 | Сиалурия, финская (болезнь Салла), детское нарушение накопления сиаловой кислоты | AR | 52 | 54 |
SLC25A15 | Синдром гиперорнитинемии-гипераммониемии-гомоцитруллинемии | AR | 24 | 36 |
SLC46A1 | Мальабсорбция фолиевой кислоты | AR | 17 | 23 |
SMPD1 | Болезнь Ниманна-Пика | AR | 110 | 249 |
SUMF1 | Множественный дефицит сульфатазы | AR | 21 | 53 |
SUOX | сульфоцистеинурия | AR | 8 | 29 |
TCF4 | Дистрофия роговицы, эндотелий Фукса, синдром Питта-Хопкинса | AD | 105 | 146 |
TPP1 | Спиноцеребеллярная атаксия, Нейрональный цероидный липофусциноз 2 типа | AR | 75 | 112 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.
Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.