Анализы ДНК в Украине
Все анализы/Панели (секвенирование NGS)
В панель Первичная гипероксалурия входит 3 гена, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.
Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на первичную гипероксалурию.
Первичные гипероксалурии — это редкие нарушения метаболизма глиоксилата, которые приводят к значительному увеличению эндогенного синтеза оксалатов печенью. Они характеризуются избытком оксалата, что приводит к проявлениям, варьирующимся от случайных почечных камней, рецидивирующего нефролитиаза и нефрокальциноза до терминальной стадии почечной недостаточности (ESRD) и системного оксалоза. Проявляется в период от неонатального периода до зрелого возраста. Среди расстройств, вызывающих гипероксалурию, первичные гипероксалурии являются наиболее тяжелыми, в конечном итоге приводящими к ESRD и, если их не лечить, к смерти у большинства пациентов. Первичная гипероксалурия I типа (PH1) вызвана недостаточной или отсутствующей активностью специфической для печени пероксисомальной аланинглиоксилатаминотрансферазы (AGT). У некоторых пациентов с заболеванием типа PH1 фермент присутствует, но не нацелен на митохондрии, где он метаболически неактивен. Тяжелая инфантильная форма характеризуется задержкой развития, нефрокальцинозом с нефролитиазом или без него и ранней терминальной стадией почечной недостаточности. Начало в детском и подростковом возрасте часто характеризуется рецидивирующим уролитиазом (с нефрокальцинозом или без него) и прогрессирующей почечной недостаточностью. Поздняя форма характеризуется случайными почечными камнями с началом во взрослом возрасте, но может возникнуть острая почечная недостаточность, вызванная двусторонней обструкцией почек оксалатными камнями. Другие проявления включают инфекции мочевыводящих путей, дизурию и гематурию. Продолжающийся системный оксалез также может привести к другим клиническим проявлениям, таким как дефекты сердечной проводимости, сосудистая кальцификация с дистальной гангреной, нарушение зрения, специфические коричневые отложения на сетчатке, кожные узелки, поражение суставов и заболевание костей, приводящее к переломам у длительно зависимых от диализа пациентов. Распространенность PH1, зарегистрированная в Европе, колеблется от 1:333 000 до 1:1 000 000. Более высокие значения зарегистрированы в определенных популяциях с высоким уровнем кровного родства. Первичная гипероксалурия типа II (PH2) является несколько более мягким, но не доброкачественным вариантом, который возникает в результате дефицита активности фермента глиоксилатредуктазы/гидроксипируватредуктазы (GRHPR). Дифференциальный диагноз включает болезнь Дента и семейную гиперкальциурию-гипомагниемию-нефрокальциноз, а также вторичные формы гипероксалурии (кишечную гипероксалурию, диетическую гипероксалурию) и идиопатический кальций-оксалатный уролитиаз. Эндогенную гипероксалурию необходимо дифференцировать от более распространенных вторичных форм.
Ген | Фенотип | Наслед.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AGXT | Гипероксалурия | AR | 190 | 205 |
GRHPR | Гипероксалурия | AR | 60 | 40 |
HOGA1 | Гипероксалурия | AR | 37 | 33 |
* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);
** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.
В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .
Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.
Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.
Специальной подготовки не требуется: не нужно натощак, обильно пить воду.
Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.
Забор материала у нас в центре или можно передать нам пробирку ЭДТА, взятую в любой лаборатории. О возможности забора у детей уточнять дополнительно.
В наших пунктах забора, кроме Киева, забор материала стоит .
Необходимо предоставить заключение врача с клинической картиной (описание симтомов, диагноз), заполнить в электронном виде анкету.
Анализ не проводится для здоровых людей без сипмтомов, в этом случае рекомендуются скрининговые анализы на носительство.
По результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.